More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1780 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1780  phosphate uptake regulator  100 
 
 
224 aa  447  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.210752  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0395  phosphate transport system regulatory protein PhoU  55.61 
 
 
226 aa  258  6e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  54.55 
 
 
219 aa  214  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  51.17 
 
 
232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  50 
 
 
224 aa  194  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  48.1 
 
 
222 aa  193  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31900  phosphate uptake regulator, PhoU  49.05 
 
 
223 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  41.4 
 
 
217 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  43.33 
 
 
219 aa  158  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37610  phosphate uptake regulator, PhoU  40.85 
 
 
220 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  40.85 
 
 
238 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0848  phosphate uptake regulator, PhoU  39.52 
 
 
220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  40.48 
 
 
221 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.42 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  40.48 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  38.1 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  40.85 
 
 
220 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  38.03 
 
 
217 aa  145  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  38.1 
 
 
215 aa  142  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  37.62 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  39.63 
 
 
222 aa  139  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09310  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.22 
 
 
226 aa  138  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4320  phosphate uptake regulator, PhoU  36.7 
 
 
220 aa  138  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3538  phosphate uptake regulator, PhoU  37.27 
 
 
220 aa  129  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1665  phosphate uptake regulator, PhoU  37.56 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4897  phosphate uptake regulator, PhoU  38.57 
 
 
222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4514  phosphate uptake regulator, PhoU  38.57 
 
 
222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4601  phosphate uptake regulator, PhoU  38.57 
 
 
222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13330  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY1  35.35 
 
 
221 aa  128  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2218  phosphate uptake regulator, PhoU  37.14 
 
 
216 aa  128  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0150232 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0090  phosphate uptake regulator, PhoU  37.62 
 
 
220 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10836  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY2  36.57 
 
 
213 aa  123  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3921  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.81 
 
 
220 aa  121  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4977  phosphate uptake regulator, PhoU  38.1 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5088  phosphate uptake regulator, PhoU  36.57 
 
 
222 aa  118  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  35.71 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0285  phosphate uptake regulator, PhoU  37.8 
 
 
214 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376291  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0329  phosphate uptake regulator, PhoU  39.23 
 
 
214 aa  114  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0770036  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2908  phosphate uptake regulator, PhoU  38.89 
 
 
231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3448  phosphate uptake regulator, PhoU  33.81 
 
 
230 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741283  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  30.73 
 
 
219 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  32.57 
 
 
217 aa  106  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  30.73 
 
 
215 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  29.11 
 
 
218 aa  105  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  34.12 
 
 
218 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  29.57 
 
 
225 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  27.36 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0128  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.244717  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  26.92 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  33.48 
 
 
218 aa  98.6  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  31.02 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  32.09 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  31.63 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  30.66 
 
 
220 aa  95.5  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  31.78 
 
 
234 aa  95.5  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  31.7 
 
 
226 aa  95.5  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  28.64 
 
 
229 aa  95.1  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  29.74 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.76 
 
 
240 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  28.32 
 
 
240 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.76 
 
 
240 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  30.48 
 
 
232 aa  92.8  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  30.95 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  32.42 
 
 
219 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  28.44 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  30.52 
 
 
216 aa  92.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  25.96 
 
 
228 aa  92.4  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0485  phosphate uptake regulator, PhoU  25.47 
 
 
233 aa  92  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.89743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  29.25 
 
 
228 aa  92  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  29.25 
 
 
233 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  28.37 
 
 
217 aa  91.7  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  29.91 
 
 
231 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3639  transcriptional regulator PhoU  28.1 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  30.28 
 
 
228 aa  90.1  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  28.57 
 
 
244 aa  90.1  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  28.57 
 
 
242 aa  89.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  28.95 
 
 
236 aa  89.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  29.25 
 
 
220 aa  89.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  29.72 
 
 
216 aa  89.7  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  32.11 
 
 
217 aa  89  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3204  phosphate uptake regulator, PhoU  36.19 
 
 
234 aa  89  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  32.71 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2385  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.041607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  30.52 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1568  phosphate uptake regulator, PhoU  25 
 
 
233 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  32.73 
 
 
239 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  25.79 
 
 
235 aa  86.3  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  30.41 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0880  phosphate uptake regulator, PhoU  30.23 
 
 
226 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0701467 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  29.05 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  27.14 
 
 
237 aa  85.9  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0489  phosphate uptake regulator, PhoU  31.42 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.762813  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  22.6 
 
 
224 aa  86.3  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  29.44 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  31.16 
 
 
218 aa  85.5  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  29.33 
 
 
234 aa  85.9  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  27.43 
 
 
236 aa  85.5  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  27.57 
 
 
232 aa  85.1  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>