More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0992 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  42.59 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  40.57 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  41.67 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  42.33 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3453  phosphate uptake regulator, PhoU  40.91 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  42.01 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0310  phosphate uptake regulator, PhoU  39.81 
 
 		 218 aa  147  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.368967  normal  0.0297359 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  41.82 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  37.27 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0239  phosphate uptake regulator, PhoU  40.83 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  38.39 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  37.14 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  38.81 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  36.53 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  37.61 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4001  phosphate uptake regulator, PhoU  39.32 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  38.39 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4008  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.21 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  36.97 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4288  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.21 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0302949 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  34.42 
 
 		 217 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  38.07 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4348  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  36.74 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  36.74 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  35.78 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4401  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.74 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4170  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.74 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4492  phosphate transporter PhoU  36.74 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  35.89 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  34.86 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  35.27 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  35.38 
 
 		 225 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3639  transcriptional regulator PhoU  31.9 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  35.07 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4121  phosphate uptake regulator, PhoU  36.24 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  35.27 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  35.19 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  36.84 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  36.84 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  34.45 
 
 		 236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  35.07 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  36.49 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.81 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  34.3 
 
 		 244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  33.81 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  37.32 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  35.1 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  35.1 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  35.1 
 
 		 241 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  35.1 
 
 		 241 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  35.35 
 
 		 217 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  35.1 
 
 		 241 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  35.1 
 
 		 241 aa  124  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  35.1 
 
 		 241 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  35.1 
 
 		 241 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  35.1 
 
 		 241 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  36.84 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.65 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  35.58 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  33.17 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0852  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.81 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4384  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.81 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  32.85 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  35.58 
 
 		 239 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  35.35 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  34.3 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  34.3 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  34.3 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.85 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  36.19 
 
 		 236 aa  121  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  31.8 
 
 		 216 aa  122  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  35.07 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.81 
 
 		 237 aa  121  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  33.81 
 
 		 237 aa  121  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  33.81 
 
 		 237 aa  121  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  34.29 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  35.58 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  35.58 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  36.84 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  32.85 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.26 
 
 		 234 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  35.91 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  35.35 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  31.65 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  37.74 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  34.62 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  35.55 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.15 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  35.1 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  37.32 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>