More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0395 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0395  phosphate transport system regulatory protein PhoU  100 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1780  phosphate uptake regulator  55.61 
 
 		 224 aa  258  6e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.210752  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  44.29 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  43.46 
 
 		 217 aa  181  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  41.82 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31900  phosphate uptake regulator, PhoU  42.47 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  42.38 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  43.19 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  38.1 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  39.05 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  39.05 
 
 		 215 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  37.62 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  40.48 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  34.88 
 
 		 217 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37610  phosphate uptake regulator, PhoU  37.16 
 
 		 220 aa  148  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  34.86 
 
 		 222 aa  143  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09310  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.57 
 
 		 226 aa  141  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0848  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 220 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  36.7 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1665  phosphate uptake regulator, PhoU  36.74 
 
 		 222 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13330  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY1  34.88 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4897  phosphate uptake regulator, PhoU  36.2 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4514  phosphate uptake regulator, PhoU  36.2 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4601  phosphate uptake regulator, PhoU  36.2 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  35.68 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4320  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.14 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10836  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY2  36.15 
 
 		 213 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  36.19 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3921  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.49 
 
 		 220 aa  128  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5088  phosphate uptake regulator, PhoU  35.65 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3538  phosphate uptake regulator, PhoU  32.88 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0090  phosphate uptake regulator, PhoU  33.81 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2908  phosphate uptake regulator, PhoU  38.97 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0329  phosphate uptake regulator, PhoU  34.29 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0770036  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3448  phosphate uptake regulator, PhoU  34.29 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  32.71 
 
 		 218 aa  111  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0285  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 214 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376291  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4977  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  31.82 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  26.17 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2218  phosphate uptake regulator, PhoU  28.9 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0150232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  28.57 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  28.64 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  24.64 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  29.77 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0485  phosphate uptake regulator, PhoU  25.94 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.89743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  28.44 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 		 228 aa  95.5  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  31.94 
 
 		 218 aa  95.5  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1568  phosphate uptake regulator, PhoU  25.23 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  27.83 
 
 		 221 aa  95.1  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  29.11 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  27.91 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  29.15 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3204  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  29.02 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.15 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.15 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.6 
 
 		 237 aa  92  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  29.6 
 
 		 237 aa  92  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  27.43 
 
 		 239 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  29.15 
 
 		 237 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  27.91 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  29.73 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  23.47 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  29.73 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  29.91 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  31.67 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  25 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  29.17 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  30.18 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  28.02 
 
 		 228 aa  89.4  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0128  phosphate uptake regulator, PhoU  32.39 
 
 		 214 aa  89.4  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.244717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  29.49 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  29.72 
 
 		 216 aa  88.6  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  29.49 
 
 		 244 aa  88.2  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  29.28 
 
 		 242 aa  88.2  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  29.3 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  31.05 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3639  transcriptional regulator PhoU  27.57 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  28.23 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2864  phosphate uptake regulator, PhoU  32.97 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  26.98 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  27.27 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0947  phosphate uptake regulator, PhoU  26.51 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  29.28 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  30.05 
 
 		 256 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  28.32 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  30.05 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  30.05 
 
 		 256 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  29.38 
 
 		 242 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  28.24 
 
 		 243 aa  85.1  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  27.31 
 
 		 226 aa  84.7  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.17 
 
 		 232 aa  84.7  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  27.62 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  28.24 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>