More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1929 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 226 aa  457  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  44.19 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  41.18 
 
 		 227 aa  158  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  41.1 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  38.71 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  39.11 
 
 		 222 aa  148  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  42.06 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  39.51 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  36.7 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  37.16 
 
 		 233 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  37.9 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  38.6 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  40.28 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  38.43 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.53 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  39.91 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  37.67 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  38.53 
 
 		 223 aa  138  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  38.53 
 
 		 223 aa  138  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  35.43 
 
 		 231 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0947  phosphate uptake regulator, PhoU  44.71 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  37.33 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  43.98 
 
 		 228 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  41.9 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  41.88 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  36.53 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  43.16 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  37.56 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  36.97 
 
 		 217 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  34.86 
 
 		 241 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  37.38 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  37.38 
 
 		 216 aa  131  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  43.41 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.73 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  38.74 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  34.63 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  33.48 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  42.71 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  36.04 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  35.78 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  36.82 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  35.59 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  34.1 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  35.59 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  35.59 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  36.24 
 
 		 240 aa  128  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  36.49 
 
 		 216 aa  128  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  34.84 
 
 		 233 aa  128  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  43.02 
 
 		 232 aa  128  8.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  35.21 
 
 		 218 aa  128  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  37.44 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  35.59 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  35.14 
 
 		 256 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  39.15 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  35.59 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  39.15 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  35.75 
 
 		 242 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  35.59 
 
 		 242 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  35.14 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  36.57 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  32.42 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  33.33 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  37.1 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  33.94 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  33.19 
 
 		 237 aa  121  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  33.19 
 
 		 237 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  31.78 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  32.87 
 
 		 222 aa  121  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 226 aa  121  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  34.7 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  35.37 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1876  phosphate uptake regulator, PhoU  35.35 
 
 		 217 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2659  phosphate uptake regulator, PhoU  36.65 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  36.11 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  35.43 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  33.78 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  35.84 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1909  phosphate uptake regulator, PhoU  33.48 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.553702  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  32.27 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3639  transcriptional regulator PhoU  31.98 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  33.49 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  33.03 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  31.75 
 
 		 226 aa  118  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  35.1 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  36.45 
 
 		 220 aa  118  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  32.46 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  35.71 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  33.19 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  32.46 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  33.62 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  32.46 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2630  phosphate uptake regulator, PhoU  31.96 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608204  normal  0.109033 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2385  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.041607  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  35.27 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  34.05 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  34.82 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  32.13 
 
 		 232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  33.94 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3442  phosphate uptake regulator, PhoU  34.55 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>