More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1876 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1876  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
217 aa  440  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  57.14 
 
 
218 aa  262  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0987  phosphate transport system regulatory protein PhoU  53.46 
 
 
217 aa  249  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.188055  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0594  phosphate uptake regulator, PhoU  41.67 
 
 
224 aa  181  6e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0561  phosphate uptake regulator, PhoU  38.43 
 
 
228 aa  165  5e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0552  phosphate uptake regulator  37.74 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5092700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1564  phosphate uptake regulator, PhoU  38.21 
 
 
234 aa  159  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.416794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  34.56 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  31.13 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  34.12 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  31.13 
 
 
225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  30.48 
 
 
229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  31.8 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  35.35 
 
 
226 aa  121  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  32.21 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  33.17 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  29.86 
 
 
223 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  29.72 
 
 
222 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.86 
 
 
228 aa  118  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  29.86 
 
 
223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  32.71 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  28.91 
 
 
223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  32.72 
 
 
218 aa  115  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  30.29 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  31.8 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1148  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0480407 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  30.48 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1598  phosphate uptake regulator, PhoU  34.58 
 
 
235 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  30.14 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  31.9 
 
 
243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  30.23 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  29.05 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  29.05 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  30.23 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 
234 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  31.88 
 
 
230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  29.19 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 
234 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 
234 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3442  phosphate uptake regulator, PhoU  31.05 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.65 
 
 
247 aa  108  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  32.09 
 
 
234 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 
233 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 
234 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  32.09 
 
 
234 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  31.43 
 
 
236 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4447  phosphate uptake regulator, PhoU  31.13 
 
 
234 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  30.41 
 
 
221 aa  106  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  32.39 
 
 
218 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  30.77 
 
 
231 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 
234 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  31.43 
 
 
236 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  31.43 
 
 
236 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  29.33 
 
 
231 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1181  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 
234 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449533  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  31.43 
 
 
236 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  29.77 
 
 
218 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  29.58 
 
 
234 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  28.44 
 
 
222 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  28.99 
 
 
224 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  30.95 
 
 
236 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3639  transcriptional regulator PhoU  31.6 
 
 
233 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  31.43 
 
 
233 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.77 
 
 
221 aa  105  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  28.77 
 
 
221 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 
253 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  31.25 
 
 
233 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  30.95 
 
 
239 aa  105  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  31.75 
 
 
256 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.66 
 
 
234 aa  104  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  30.29 
 
 
236 aa  105  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3453  phosphate uptake regulator, PhoU  28.7 
 
 
216 aa  104  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  29.19 
 
 
237 aa  104  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  27.7 
 
 
239 aa  104  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  31.9 
 
 
256 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4384  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.13 
 
 
218 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  30.95 
 
 
236 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  30.95 
 
 
236 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  31.9 
 
 
256 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  30.95 
 
 
236 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  30.95 
 
 
236 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  31.28 
 
 
242 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  28.57 
 
 
235 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  31.28 
 
 
256 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  28.85 
 
 
236 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  29.63 
 
 
219 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0852  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.13 
 
 
218 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1519  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.19 
 
 
234 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  30.81 
 
 
253 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0784  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.19 
 
 
234 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  29.11 
 
 
234 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.19 
 
 
234 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.19 
 
 
234 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1489  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.19 
 
 
234 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.19 
 
 
234 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.19 
 
 
234 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>