More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1564 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1564  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 234 aa  476  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.416794  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0552  phosphate uptake regulator  46.85 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.5092700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0987  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.57 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.188055  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  39.15 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1876  phosphate uptake regulator, PhoU  38.21 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0594  phosphate uptake regulator, PhoU  36.07 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0561  phosphate uptake regulator, PhoU  34.67 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  37.67 
 
 		 215 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  31.94 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  32.58 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  31.82 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  31.98 
 
 		 239 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  31.36 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  31.36 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  35.58 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  35.58 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  35.58 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  33.63 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03148  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.11 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  31.25 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  31.78 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  30.95 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  31.48 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  29.91 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  30.28 
 
 		 239 aa  118  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  34.43 
 
 		 242 aa  118  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  34.62 
 
 		 256 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  36.7 
 
 		 216 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  34.91 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  35.81 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  30.45 
 
 		 234 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  34.13 
 
 		 253 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2266  phosphate uptake regulator, PhoU  35.1 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  32.88 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  31.46 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  33.49 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  30.73 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  31.73 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  28.64 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.13 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  33.65 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  31.25 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  30.73 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  34.6 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  34.6 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  34.6 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  30.62 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.22 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  34.12 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  30.62 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  30.28 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  32.26 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  31.1 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  30.28 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.21 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  31.73 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  33.02 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  31.25 
 
 		 237 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.25 
 
 		 237 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  31.73 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  29.69 
 
 		 244 aa  111  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  31.25 
 
 		 237 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  32.08 
 
 		 231 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  32.21 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  30.14 
 
 		 242 aa  111  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  30.14 
 
 		 243 aa  111  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  33.65 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  29.26 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  28.76 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  30.14 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2742  transcriptional regulator PhoU  32.21 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.498773  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  33.65 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1930  phosphate uptake regulator, PhoU  34.13 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000762958  normal  0.0700968 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  30.23 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  32.69 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0265  phosphate uptake regulator, PhoU  30.92 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  33.65 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  33.65 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  29.67 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  33.65 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  30.73 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  30.81 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  29.81 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  29.67 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  29.81 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  31.25 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  29.81 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  29.26 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.64 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>