More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0552 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0552  phosphate uptake regulator  100 
 
 		 227 aa  458  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.5092700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1564  phosphate uptake regulator, PhoU  46.85 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.416794  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  41.98 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0987  phosphate transport system regulatory protein PhoU  43.4 
 
 		 217 aa  192  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.188055  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0594  phosphate uptake regulator, PhoU  36.87 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1876  phosphate uptake regulator, PhoU  37.74 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0561  phosphate uptake regulator, PhoU  35.75 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  36.62 
 
 		 218 aa  141  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  34.56 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  34.76 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  34.58 
 
 		 217 aa  128  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  32.43 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  35.1 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  34.58 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  34.62 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  36.92 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  34.6 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 236 aa  118  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  34.42 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  30.43 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  35.9 
 
 		 226 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  33.82 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  31.88 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  31.4 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  33.67 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  31.46 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  30.92 
 
 		 256 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  30.92 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  30.92 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  32.54 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  32.06 
 
 		 219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  29.58 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  31.4 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4413  phosphate uptake regulator, PhoU  32.37 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  30.43 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  31.92 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  28.85 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 		 256 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2266  phosphate uptake regulator, PhoU  30.92 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  31.31 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.63 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1446  phosphate uptake regulator, PhoU  34.3 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1475  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.3 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632881  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  30.52 
 
 		 219 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  32.55 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  31.25 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1782  phosphate uptake regulator, PhoU  32.87 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  30.19 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  29.95 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  29.49 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.92 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  31.4 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  32.2 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.46 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  31.22 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  29.95 
 
 		 253 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  27.49 
 
 		 242 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  31.28 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  32.66 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  30.58 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  32.37 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  31.94 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  30.73 
 
 		 236 aa  104  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  32.35 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  31.37 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  27.01 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  31.86 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  29.38 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  28.44 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  28.44 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2405  phosphate uptake regulator, PhoU  27.54 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  27.01 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  27.8 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  32.35 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  32.06 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  29.03 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.73 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  30.18 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4121  phosphate uptake regulator, PhoU  32.09 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0608  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.41 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00182216  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  30.73 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.33 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37610  phosphate uptake regulator, PhoU  31.56 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4008  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.63 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1930  phosphate uptake regulator, PhoU  29.81 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000762958  normal  0.0700968 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  31.86 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  31.1 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4288  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.63 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0302949 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  31.78 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  30.73 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  30.43 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.41 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00632575  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  28.99 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  32.71 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  31.63 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  29.33 
 
 		 229 aa  101  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2223  phosphate uptake regulator, PhoU  28.85 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>