More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1930 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1930  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 243 aa  499  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000762958  normal  0.0700968 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2223  phosphate uptake regulator, PhoU  94.65 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2266  phosphate uptake regulator, PhoU  69.62 
 
 		 249 aa  361  6e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  48.46 
 
 		 240 aa  241  7.999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  45.99 
 
 		 256 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  45.99 
 
 		 256 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  44.92 
 
 		 253 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  46.52 
 
 		 256 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  46.09 
 
 		 256 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  45.76 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  44.49 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  45.3 
 
 		 242 aa  229  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  46.49 
 
 		 242 aa  228  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  46.49 
 
 		 242 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  46.82 
 
 		 247 aa  221  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4413  phosphate uptake regulator, PhoU  44.39 
 
 		 236 aa  211  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  42.92 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  44.78 
 
 		 239 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  40.52 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  42.67 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2405  phosphate uptake regulator, PhoU  39.47 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  41.38 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  43.29 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  44.16 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  41.33 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  43.11 
 
 		 235 aa  188  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  42.17 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  42.17 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  40.34 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  42.42 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  40.95 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  42.06 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  42.06 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  41.3 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  38.46 
 
 		 229 aa  181  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2256  phosphate uptake regulator, PhoU  40.52 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  0.407318 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0886  phosphate uptake regulator, PhoU  41.89 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257388  normal  0.0383148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  39.32 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  39.57 
 
 		 236 aa  178  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  40.35 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  40.69 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  40.26 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  39.38 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  38.96 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  39.04 
 
 		 236 aa  174  8e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  38.2 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3639  transcriptional regulator PhoU  40.64 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1658  phosphate uptake regulator, PhoU  38.89 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  38.94 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1289  phosphate uptake regulator, PhoU  38.26 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.498595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  39.38 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  39.38 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  39.38 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  39.38 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  39.38 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  39.38 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  39.38 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  38.94 
 
 		 236 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  37.33 
 
 		 240 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  39.19 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  39.19 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1276  phosphate uptake regulator, PhoU  37.02 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  39.19 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1598  phosphate uptake regulator, PhoU  41.36 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2630  phosphate uptake regulator, PhoU  36.64 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608204  normal  0.109033 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  35.62 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0784  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.01 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.01 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1519  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.01 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.01 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.01 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.01 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.01 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1489  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.01 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2368  phosphate uptake regulator, PhoU  36.64 
 
 		 233 aa  168  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2742  transcriptional regulator PhoU  39.3 
 
 		 236 aa  167  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.498773  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  38.05 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4447  phosphate uptake regulator, PhoU  38.29 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1490  phosphate uptake regulator, PhoU  36.21 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  38.05 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4914  phosphate uptake regulator, PhoU  36.32 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24576 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  38.33 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  37.72 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  37.72 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  37.72 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  37.72 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  37.72 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  37.72 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  37.72 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  37.72 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  37.72 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  38.29 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  37.28 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  37.28 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  37.28 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  37.28 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  37.28 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  37.84 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1181  phosphate uptake regulator, PhoU  37.84 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>