More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0947 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0947  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
228 aa  459  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  64.91 
 
 
228 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  64.47 
 
 
228 aa  296  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  62.28 
 
 
228 aa  291  8e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  60.53 
 
 
228 aa  277  9e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  57.33 
 
 
228 aa  263  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  57.99 
 
 
219 aa  257  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  48.25 
 
 
232 aa  223  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0432  hypothetical protein  46.67 
 
 
223 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2864  phosphate uptake regulator, PhoU  44.74 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  44.71 
 
 
226 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  40.19 
 
 
215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  35.89 
 
 
215 aa  124  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.41 
 
 
224 aa  122  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  37.21 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  39.24 
 
 
234 aa  111  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  39.02 
 
 
217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  29.77 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  28.7 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  28.04 
 
 
233 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  31.58 
 
 
224 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  31.31 
 
 
229 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  27.57 
 
 
233 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.58 
 
 
228 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  27.57 
 
 
233 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  31.28 
 
 
223 aa  104  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  36.31 
 
 
226 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 
223 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 
223 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  31.88 
 
 
219 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  31.43 
 
 
222 aa  102  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  38.04 
 
 
221 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  34.71 
 
 
223 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  34.71 
 
 
223 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  33.71 
 
 
236 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  28.5 
 
 
216 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  30.81 
 
 
236 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  34.3 
 
 
243 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  32.94 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  36.09 
 
 
238 aa  99.4  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  33.74 
 
 
236 aa  98.6  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
214 aa  98.2  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.75 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  29.44 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  29.44 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  30.23 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  30.77 
 
 
221 aa  96.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  27.31 
 
 
233 aa  95.5  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0456  phosphate uptake regulator, PhoU  30.14 
 
 
229 aa  95.5  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  29.72 
 
 
222 aa  95.5  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0909  phosphate uptake regulator, PhoU  32.09 
 
 
226 aa  95.1  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  31.36 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  31.94 
 
 
219 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  31.36 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  30.54 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  31.03 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  31.18 
 
 
233 aa  94  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1568  phosphate uptake regulator, PhoU  27.75 
 
 
233 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  31.31 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.7 
 
 
247 aa  94  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  30.3 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  28.71 
 
 
253 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  27.27 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  31.34 
 
 
227 aa  92.4  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  32.94 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  29.72 
 
 
224 aa  92.4  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  30.09 
 
 
219 aa  92  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  32.37 
 
 
218 aa  91.7  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  28.24 
 
 
242 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  32.39 
 
 
219 aa  91.7  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0987  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.57 
 
 
217 aa  91.7  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.188055  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  28.24 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2484  phosphate uptake regulator, PhoU  31.16 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  35.93 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0128  phosphate uptake regulator, PhoU  28.49 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.244717  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  36.53 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  28.24 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  29.76 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  31.84 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  28.24 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  31.52 
 
 
225 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  29.41 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1596  phosphate uptake regulator, PhoU  28.57 
 
 
224 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.215109  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0091  phosphate uptake regulator, PhoU  31.36 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3442  phosphate uptake regulator, PhoU  28.23 
 
 
225 aa  90.1  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  27.78 
 
 
253 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1962  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  30.37 
 
 
218 aa  89.4  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  28.22 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2279  phosphate uptake regulator, PhoU  33.55 
 
 
216 aa  89  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03148  phosphate transport system regulatory protein PhoU  26.43 
 
 
246 aa  89.4  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  27.78 
 
 
253 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  32.73 
 
 
217 aa  88.6  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0506  phosphate uptake regulator, PhoU  30.18 
 
 
232 aa  88.6  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 
217 aa  88.6  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0265  phosphate uptake regulator, PhoU  30.18 
 
 
237 aa  88.6  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  27.35 
 
 
218 aa  88.6  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  30.48 
 
 
242 aa  88.6  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  28.1 
 
 
238 aa  88.6  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  27.78 
 
 
256 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>