More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0432 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0432  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  56.76 
 
 		 219 aa  241  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  52.63 
 
 		 228 aa  226  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  53.33 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  51.56 
 
 		 228 aa  215  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  49.33 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0947  phosphate uptake regulator, PhoU  46.67 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  46.93 
 
 		 232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  44.44 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2864  phosphate uptake regulator, PhoU  40.87 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  38.36 
 
 		 215 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  39.62 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.98 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  34.58 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  40.51 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  38.61 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  38.06 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  40.51 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  40.51 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  37.97 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  36.75 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  31.19 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  35.96 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  35.8 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  38.22 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  33.55 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.33 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  34.81 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  32.31 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  31.31 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  34.21 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  34.21 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  32.93 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  36.42 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  33.99 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  32.47 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 220 aa  88.6  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  35.48 
 
 		 221 aa  88.2  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  32.43 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  34.76 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  30.37 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  32.93 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  30.82 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  31.01 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  32.03 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  30.38 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  29.75 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  30.38 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.69 
 
 		 237 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  32.69 
 
 		 237 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  32.69 
 
 		 237 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  33.76 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  31.65 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  31.41 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  28.64 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  33.53 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  34.62 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  36.77 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  31.66 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  32.14 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1920  phosphate uptake regulator, PhoU  32.14 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  33.12 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  28.83 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  33.12 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  33.12 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  30.58 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  30.58 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  32.28 
 
 		 243 aa  81.6  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0483  phosphate uptake regulator, PhoU  30.97 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  33.12 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  32.47 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  30.32 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  32.88 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  33.76 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  28.97 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  31.07 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  33.12 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  33.12 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.27 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  32.5 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5088  phosphate uptake regulator, PhoU  35.44 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1665  phosphate uptake regulator, PhoU  35.15 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  31.65 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  29.13 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  32.5 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  33.12 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  29.06 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  34.18 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  35.57 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  27.59 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  31.87 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  28.11 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  33.12 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4514  phosphate uptake regulator, PhoU  35.44 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  31.28 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4897  phosphate uptake regulator, PhoU  35.44 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  34.18 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>