More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2864 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2864  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  63.16 
 
 		 232 aa  288  4e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  52.19 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  52.19 
 
 		 228 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  51.32 
 
 		 228 aa  231  6e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  50 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  50.23 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  43.86 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0947  phosphate uptake regulator, PhoU  44.74 
 
 		 228 aa  201  8e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0432  hypothetical protein  41.67 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  41.3 
 
 		 215 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  35.89 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  34.97 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.23 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.13 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  32.13 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  38.1 
 
 		 226 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  42.58 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  31.43 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  31.53 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  36.54 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  30.32 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  32.26 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.95 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4008  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.03 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  31.03 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  33.82 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  32.31 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4401  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.07 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4288  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.03 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0302949 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  37.93 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  34.78 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  34.12 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  32.8 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4348  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  31.07 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4170  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.03 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4492  phosphate transporter PhoU  31.03 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  32.38 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  31.34 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  30.24 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  33.82 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  35.75 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  30.19 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  35.03 
 
 		 226 aa  102  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 238 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  32.06 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  29.39 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0909  phosphate uptake regulator, PhoU  32.13 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  31.43 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  32.54 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0489  phosphate uptake regulator, PhoU  31.19 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.762813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  32.8 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1511  phosphate uptake regulator, PhoU  32.13 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  32.84 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0091  phosphate uptake regulator, PhoU  30.56 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  31.16 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  31.43 
 
 		 233 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3639  transcriptional regulator PhoU  29.52 
 
 		 233 aa  99  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 223 aa  99.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0540  phosphate uptake regulator, PhoU  31.19 
 
 		 247 aa  99  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  30.53 
 
 		 239 aa  99  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  32.82 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  32.84 
 
 		 239 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  31.37 
 
 		 238 aa  98.6  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  29.5 
 
 		 232 aa  98.6  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  31.73 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  31.72 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  30.81 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  32.8 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  32.73 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  33.16 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  30.48 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  28.3 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2484  phosphate uptake regulator, PhoU  30.73 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4384  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.56 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  32.26 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  29.78 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.5 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  31.75 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0128  phosphate uptake regulator, PhoU  29.06 
 
 		 214 aa  95.5  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.244717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  29.63 
 
 		 220 aa  95.5  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  34.22 
 
 		 256 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0852  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.56 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0903  phosphate uptake regulator, PhoU  30.23 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.656242  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  34.22 
 
 		 256 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  34.22 
 
 		 256 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4121  phosphate uptake regulator, PhoU  28.08 
 
 		 228 aa  95.1  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  31.63 
 
 		 237 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.63 
 
 		 237 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  31.63 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3555  phosphate uptake regulator, PhoU  39.15 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1787  phosphate uptake regulator, PhoU  30.63 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.276553  normal  0.0287996 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  26.5 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>