More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1920 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1920  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
216 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2279  phosphate uptake regulator, PhoU  50.46 
 
 
216 aa  223  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0483  phosphate uptake regulator, PhoU  49.07 
 
 
216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2984  phosphate uptake regulator, PhoU  38.6 
 
 
216 aa  149  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  36.79 
 
 
215 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  34.91 
 
 
217 aa  141  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  32.08 
 
 
217 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  35.21 
 
 
234 aa  135  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1115  phosphate uptake regulator, PhoU  33.94 
 
 
218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.567371  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  34.6 
 
 
219 aa  131  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  34.74 
 
 
216 aa  131  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  35.89 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  35.55 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  34.43 
 
 
218 aa  128  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  36.54 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  34.62 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.07 
 
 
235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  32.55 
 
 
219 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  34.12 
 
 
240 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.81 
 
 
237 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  34.3 
 
 
240 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  33.81 
 
 
237 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
237 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  34.76 
 
 
242 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 
224 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  35.68 
 
 
237 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  36.15 
 
 
240 aa  122  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  34.62 
 
 
242 aa  122  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.82 
 
 
240 aa  121  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.82 
 
 
240 aa  121  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 
239 aa  121  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  34.74 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  34.11 
 
 
234 aa  119  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  32.85 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  33.81 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  31.1 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  30.58 
 
 
256 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  29.86 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  28.64 
 
 
225 aa  112  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  30.14 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.33 
 
 
228 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  31.03 
 
 
226 aa  111  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  30.81 
 
 
237 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  31.13 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0091  phosphate uptake regulator, PhoU  30.43 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  30.33 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  31.75 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  31.75 
 
 
238 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  29.81 
 
 
243 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  30.52 
 
 
230 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  30.1 
 
 
221 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.61 
 
 
221 aa  105  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  31.46 
 
 
238 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 
238 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  28.23 
 
 
220 aa  105  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  29.72 
 
 
234 aa  105  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  28.57 
 
 
233 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  31.1 
 
 
232 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  30.37 
 
 
216 aa  105  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0485  phosphate uptake regulator, PhoU  29.52 
 
 
233 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.89743  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  33.65 
 
 
237 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  28.3 
 
 
223 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  30.48 
 
 
238 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  28.64 
 
 
224 aa  103  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  29.19 
 
 
223 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  29.19 
 
 
223 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4121  phosphate uptake regulator, PhoU  32.23 
 
 
228 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1782  phosphate uptake regulator, PhoU  29.49 
 
 
216 aa  102  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1568  phosphate uptake regulator, PhoU  29.52 
 
 
233 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 
233 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  32.21 
 
 
236 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  30.29 
 
 
238 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  29.05 
 
 
227 aa  102  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0903  phosphate uptake regulator, PhoU  30.81 
 
 
218 aa  101  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.656242  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1525  phosphate uptake regulator, PhoU  28.84 
 
 
230 aa  101  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  31.05 
 
 
216 aa  101  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0128  phosphate uptake regulator, PhoU  30.37 
 
 
214 aa  101  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.244717  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  29.33 
 
 
239 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  28.85 
 
 
236 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  29.52 
 
 
233 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  32.49 
 
 
236 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  30.05 
 
 
239 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  30.95 
 
 
220 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  28.1 
 
 
223 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 
233 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  27.78 
 
 
220 aa  99.4  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 
219 aa  99  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.4 
 
 
240 aa  98.6  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  30.05 
 
 
238 aa  98.6  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
233 aa  98.2  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  27.14 
 
 
223 aa  97.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  28.5 
 
 
240 aa  97.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  29.52 
 
 
231 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19340  phosphate uptake regulator, PhoU  27.91 
 
 
217 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4384  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.75 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  28.3 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  29.63 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>