More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0506 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0506  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 232 aa  449  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1787  phosphate uptake regulator, PhoU  59.66 
 
 		 226 aa  254  9e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.276553  normal  0.0287996 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0489  phosphate uptake regulator, PhoU  54.08 
 
 		 223 aa  231  5e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.762813  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1596  phosphate uptake regulator, PhoU  56.22 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.215109  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2484  phosphate uptake regulator, PhoU  53.65 
 
 		 223 aa  224  9e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0909  phosphate uptake regulator, PhoU  52.79 
 
 		 226 aa  221  9e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3442  phosphate uptake regulator, PhoU  54.7 
 
 		 225 aa  221  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  52.36 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2346  phosphate uptake regulator, PhoU  54.08 
 
 		 224 aa  208  7e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3555  phosphate uptake regulator, PhoU  49.79 
 
 		 225 aa  207  8e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1788  phosphate uptake regulator, PhoU  49.58 
 
 		 222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.135594  normal  0.0168871 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  45.06 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  31.56 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  32.02 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  32.14 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  34.35 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  33.04 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  30.09 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  32.35 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  31.7 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  31.93 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  29.78 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  28.04 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  30.54 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  32.35 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  32.03 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  30.3 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  31.49 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  32.75 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  31.49 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  33.04 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.74 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  32.47 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  27.75 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  31.17 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.76 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  32.62 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1782  phosphate uptake regulator, PhoU  30.7 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  29.46 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  32.61 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  29.07 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  32.6 
 
 		 236 aa  99.4  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  28.82 
 
 		 226 aa  99.4  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  32.88 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2405  phosphate uptake regulator, PhoU  27.31 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.84 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  31.67 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  30.97 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  33.04 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  33.04 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3453  phosphate uptake regulator, PhoU  29.49 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  32.3 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  32.3 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  33.04 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  30.6 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  28.32 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  32.61 
 
 		 236 aa  96.3  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  30.13 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  30.4 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  30.13 
 
 		 242 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  31 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  32.6 
 
 		 236 aa  95.1  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  32.6 
 
 		 236 aa  95.1  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  32.6 
 
 		 236 aa  95.1  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  32.6 
 
 		 236 aa  95.1  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  29.11 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  29.69 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  29.69 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  31.28 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  32.16 
 
 		 236 aa  94.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4121  phosphate uptake regulator, PhoU  31.09 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  29.69 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4384  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.93 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  29.13 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  32.6 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  30.3 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  30.74 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3822  phosphate uptake regulator, PhoU  28.83 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.987301 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  30.04 
 
 		 218 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  31.96 
 
 		 228 aa  92.8  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0852  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.51 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2742  transcriptional regulator PhoU  31.72 
 
 		 236 aa  92.4  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.498773  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  30.57 
 
 		 239 aa  92  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  26.41 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  32.16 
 
 		 236 aa  92  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  29.69 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  29.52 
 
 		 241 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  29.52 
 
 		 241 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  29.52 
 
 		 241 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  29.52 
 
 		 241 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  29.52 
 
 		 241 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  31.17 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  27.83 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0880  phosphate uptake regulator, PhoU  31.7 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0701467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  32.16 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  33.77 
 
 		 218 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  29.69 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  31.28 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  31.72 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  32.16 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>