More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2346 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2346  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 224 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1787  phosphate uptake regulator, PhoU  68.58 
 
 		 226 aa  303  1.0000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.276553  normal  0.0287996 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0909  phosphate uptake regulator, PhoU  66.08 
 
 		 226 aa  286  1e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2484  phosphate uptake regulator, PhoU  66.96 
 
 		 223 aa  285  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0489  phosphate uptake regulator, PhoU  65.62 
 
 		 223 aa  285  2.9999999999999996e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.762813  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3442  phosphate uptake regulator, PhoU  59.29 
 
 		 225 aa  242  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  56.7 
 
 		 219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3555  phosphate uptake regulator, PhoU  54.91 
 
 		 225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0506  phosphate uptake regulator, PhoU  54.08 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1596  phosphate uptake regulator, PhoU  53.57 
 
 		 224 aa  221  8e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.215109  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1788  phosphate uptake regulator, PhoU  50.45 
 
 		 222 aa  204  6e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.135594  normal  0.0168871 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  42.15 
 
 		 222 aa  167  9e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  37.16 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  36.07 
 
 		 216 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  34.25 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2405  phosphate uptake regulator, PhoU  34.55 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  34.4 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  34.8 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  31.51 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  32.73 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  34.36 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  34.8 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.49 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  34.68 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  34.08 
 
 		 241 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  31.08 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  34.72 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  31.19 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  33.03 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  31.8 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  32.16 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  33.48 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  31.98 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  33.03 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  31.82 
 
 		 246 aa  105  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  32.13 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  31.19 
 
 		 221 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  32.13 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  33.78 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  32.13 
 
 		 244 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  31.98 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  30.97 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  31.53 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  31.44 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  32.13 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  31.44 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  31.86 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  34.25 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  32.26 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  32.58 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  32.9 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  35.14 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  32.11 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  32.13 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  32.13 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  32.13 
 
 		 238 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  31.94 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  31.82 
 
 		 217 aa  101  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.29 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1782  phosphate uptake regulator, PhoU  32.41 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  33.18 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  30.41 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  30.32 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  34.42 
 
 		 238 aa  99.4  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  30.32 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  30.32 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  30.32 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  30.32 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  28.9 
 
 		 229 aa  98.6  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.91 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  34.72 
 
 		 239 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 240 aa  98.2  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  32.11 
 
 		 236 aa  97.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  30.32 
 
 		 241 aa  97.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  32.29 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  32.29 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  32.29 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  32.29 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  31.05 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0903  phosphate uptake regulator, PhoU  29.67 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.656242  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  31.65 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  31.74 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4401  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.77 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3453  phosphate uptake regulator, PhoU  30.63 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  31.67 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  32.29 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4348  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  33.77 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  33.04 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4121  phosphate uptake regulator, PhoU  32.44 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2550  phosphate uptake regulator, PhoU  31.65 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  31.65 
 
 		 236 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  31.65 
 
 		 236 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3556  phosphate uptake regulator, PhoU  31.65 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  31.65 
 
 		 236 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  34.2 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  30.77 
 
 		 235 aa  95.9  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  31.22 
 
 		 236 aa  96.3  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2659  phosphate uptake regulator, PhoU  35.41 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>