More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1909 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1909  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 221 aa  443  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.553702  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0880  phosphate uptake regulator, PhoU  58.8 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0701467 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2385  phosphate uptake regulator, PhoU  50.7 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.041607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  47.95 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  47.93 
 
 		 218 aa  192  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  47.93 
 
 		 218 aa  192  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  43.32 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2659  phosphate uptake regulator, PhoU  40.93 
 
 		 222 aa  155  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  36.62 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  34.88 
 
 		 229 aa  141  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  36.62 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  35.98 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.35 
 
 		 228 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  36.62 
 
 		 223 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  35.38 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  35.38 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  36.19 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  35.05 
 
 		 222 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  35.98 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  36.28 
 
 		 222 aa  131  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1604  phosphate uptake regulator, PhoU  38.03 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  35.19 
 
 		 227 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  37.04 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  34.55 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  34.95 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  36.11 
 
 		 238 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  34.62 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  35.62 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  35.62 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  35.45 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  35.65 
 
 		 238 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  32.04 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  34.11 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  31.96 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  35.85 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  37.2 
 
 		 238 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  33.64 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  33.01 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  36.65 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  36.65 
 
 		 256 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  36.65 
 
 		 256 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 236 aa  121  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  36.65 
 
 		 256 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.64 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  33.48 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0382  phosphate uptake regulator, PhoU  36.06 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0872291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  33.64 
 
 		 241 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.64 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  35.65 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  33.64 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  33.64 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.49 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  31.51 
 
 		 239 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  33.64 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  33.64 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  33.64 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  30.7 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  36.53 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  35.75 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  32.71 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  32.71 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  32.71 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  32.71 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  32.71 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  32.71 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  32.71 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  31.05 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  32.71 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  32.71 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  36.65 
 
 		 253 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  35.19 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.39 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  32.39 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  36.07 
 
 		 253 aa  118  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  32.39 
 
 		 237 aa  117  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  34.11 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  34.11 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  34.11 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  32.67 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  31.34 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  33.5 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  35.75 
 
 		 242 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.23 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  34.11 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1560  phosphate uptake regulator, PhoU  34.11 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  33.64 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  33.64 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  34.47 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  35.29 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  33.03 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1511  phosphate uptake regulator, PhoU  34.58 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  33.95 
 
 		 236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  34.26 
 
 		 238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  34.45 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>