More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1604 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1604  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0382  phosphate uptake regulator, PhoU  58.11 
 
 		 227 aa  260  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0872291 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2659  phosphate uptake regulator, PhoU  45.02 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2385  phosphate uptake regulator, PhoU  40.28 
 
 		 221 aa  141  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.041607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  41.9 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0880  phosphate uptake regulator, PhoU  38.76 
 
 		 226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0701467 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1909  phosphate uptake regulator, PhoU  38.03 
 
 		 221 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.553702  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  40.87 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  40.87 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  39.71 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  34.6 
 
 		 222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  34.12 
 
 		 215 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  35.98 
 
 		 229 aa  118  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  36.45 
 
 		 226 aa  118  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  41.71 
 
 		 235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  39.23 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.67 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 		 239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  37.04 
 
 		 243 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  41.14 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  35.32 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  38.46 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  35.89 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  36.57 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  36.57 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  37.62 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  36.84 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  37.5 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4001  phosphate uptake regulator, PhoU  35.6 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  37.5 
 
 		 233 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  36.84 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  38.28 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  36.4 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  30.66 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  36.4 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  36.4 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.85 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  34.15 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  35.96 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  36.56 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  31.11 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  36.54 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  36.36 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  35.84 
 
 		 253 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  35.91 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  36.06 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  32.87 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  35.84 
 
 		 253 aa  104  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.07 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  34.3 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2405  phosphate uptake regulator, PhoU  30.59 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  32.89 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  32.11 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.65 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.65 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  35.61 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  30.8 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  32.22 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  34.07 
 
 		 228 aa  101  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  30.39 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  35.45 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  34.56 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  31.19 
 
 		 237 aa  99  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  35.43 
 
 		 240 aa  98.2  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  35.43 
 
 		 240 aa  98.2  8e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  32.35 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  28.51 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  31.05 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  31.94 
 
 		 237 aa  96.7  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  35.02 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  34.3 
 
 		 240 aa  96.3  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  32.49 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.72 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03148  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.73 
 
 		 246 aa  95.5  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 238 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4413  phosphate uptake regulator, PhoU  29.3 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  31.03 
 
 		 219 aa  95.1  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  30.22 
 
 		 235 aa  95.1  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  32.66 
 
 		 238 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  32.02 
 
 		 227 aa  95.1  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.95 
 
 		 221 aa  94.7  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  31.8 
 
 		 242 aa  95.1  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  36.62 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  34.02 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  31.78 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  27.1 
 
 		 232 aa  94  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  32.66 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  32.66 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  31.34 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4288  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.33 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0302949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  33.92 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  29.13 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  28.23 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  32.18 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  29.49 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>