More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0956 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0956  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1446  phosphate uptake regulator, PhoU  70.28 
 
 		 213 aa  312  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1475  phosphate transport system regulatory protein PhoU  70.28 
 
 		 213 aa  312  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  34.72 
 
 		 217 aa  118  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  34.91 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  34.58 
 
 		 238 aa  114  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  32.57 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  34.29 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  30.77 
 
 		 243 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  34.29 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  34.42 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  31.9 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4348  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  31.31 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  31.37 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  28.97 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  34.1 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4401  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.84 
 
 		 228 aa  104  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  30.19 
 
 		 237 aa  104  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  30.73 
 
 		 240 aa  104  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.77 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  30.19 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4384  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.84 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.77 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.19 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  30.95 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  30.37 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0852  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.84 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  30.37 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  30.37 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  31.31 
 
 		 239 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  35.65 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  32.55 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.94 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4008  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.37 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  32.35 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4288  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.37 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0302949 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4121  phosphate uptake regulator, PhoU  30.09 
 
 		 228 aa  101  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  31.46 
 
 		 239 aa  101  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  32.38 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0987  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.48 
 
 		 217 aa  101  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.188055  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  27.23 
 
 		 241 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  26.76 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4170  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.91 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  26.76 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4492  phosphate transporter PhoU  29.91 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  26.76 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  26.76 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  26.76 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.24 
 
 		 228 aa  99.4  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  31.55 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  27.23 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  27.23 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  31.31 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  27.23 
 
 		 244 aa  99  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  27.23 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  27.23 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  27.23 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  27.23 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  27.23 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  27.23 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  27.23 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  28.84 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  36.81 
 
 		 233 aa  98.6  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  31.48 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  27.23 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0552  phosphate uptake regulator  30.93 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.5092700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  31.02 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  27.23 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  32.87 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  31.73 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  31.73 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  31.8 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  27.23 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  27.23 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  35.16 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  33.81 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  28.38 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  33.01 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  35.75 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4001  phosphate uptake regulator, PhoU  32.35 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  28.3 
 
 		 236 aa  95.5  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09310  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.55 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  31.9 
 
 		 231 aa  95.1  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  29.63 
 
 		 227 aa  95.1  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  28.85 
 
 		 237 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  32.04 
 
 		 220 aa  95.1  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  28.37 
 
 		 238 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  31.63 
 
 		 218 aa  94.7  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  30.14 
 
 		 234 aa  94.7  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  31.94 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  33.95 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  28.5 
 
 		 238 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>