More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2977 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2567  response regulator receiver protein  95.87 
 
 		 339 aa  659    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2977  response regulator receiver protein  100 
 
 		 339 aa  688    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2738  response regulator transcription regulator protein  88.79 
 
 		 336 aa  587  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2812  response regulator receiver  53.41 
 
 		 335 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101507  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1291  response regulator receiver protein  53.99 
 
 		 336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127237  normal  0.0846123 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2689  response regulator receiver domain-containing protein  53.56 
 
 		 339 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.579235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2949  response regulator receiver domain-containing protein  51.64 
 
 		 332 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3729  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 323 aa  185  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.800159  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3060  response regulator receiver  46.9 
 
 		 410 aa  143  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2950  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 378 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2793  two-component response regulator  36.96 
 
 		 154 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2813  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 377 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1529  response regulator receiver  38.4 
 
 		 151 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2737  two component response regulator transcription regulator protein  36.75 
 
 		 374 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3472  response regulator receiver domain-containing protein  38.85 
 
 		 187 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1289  response regulator receiver protein  44.14 
 
 		 134 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.295021  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1404  response regulator receiver protein  38.28 
 
 		 154 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2691  response regulator receiver domain-containing protein  42.61 
 
 		 134 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3728  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 395 aa  96.7  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.439666  normal  0.0786529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2566  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.236818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1315  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2976  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 368 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.598418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4751  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 384 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259995  normal  0.0850645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2447  signal transduction protein  32.24 
 
 		 965 aa  92.8  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.936876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1895  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 185 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.706146  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  32 
 
 		 1172 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4550  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 451 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  37.78 
 
 		 1156 aa  89.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.4 
 
 		 1355 aa  89.7  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2007  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 388 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000116465  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.22 
 
 		 1180 aa  89.4  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2012  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 484 aa  89.4  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1423  response regulator receiver (CheY) and GAF domain-containing protein  40.6 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  41.61 
 
 		 1111 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26830  putative two-component response regulator  41.94 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2388  response regulator receiver protein  37.78 
 
 		 154 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.319662 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3962  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 495 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.8 
 
 		 473 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  33.95 
 
 		 270 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  35.07 
 
 		 557 aa  87.4  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2367  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.6 
 
 		 538 aa  87  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0615  response regulator  43.75 
 
 		 484 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.177724  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1525  ATP-binding region ATPase domain protein  36.44 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3476  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.73 
 
 		 479 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03496  response regulator  35.9 
 
 		 434 aa  86.7  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4317  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.13 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  40 
 
 		 456 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2158  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00791251  normal  0.142838 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0507  HupR response regulator  38.46 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1956  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.696783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2184  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 497 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.682977  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2388  response regulator  39.73 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0923  response regulator  39.73 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2469  response regulator  39.73 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129941  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2231  response regulator  43.07 
 
 		 475 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0731  response regulator  39.35 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3364  hydrogenase accessory protein HypB  38.46 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.224656 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6441  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.8 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2689  response regulator  39.73 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.13 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247955  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0757  response regulator/HD domain-containing protein  39.73 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1161  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 496 aa  84.3  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.175427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3109  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 493 aa  83.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0711  response regulator  42.34 
 
 		 518 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2745  response regulator receiver protein  40 
 
 		 456 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2363  response regulator receiver protein  32.72 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2314  response regulator  42.34 
 
 		 475 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2273  putative two-component response regulator  41.13 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.438912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1923  response regulator  42.34 
 
 		 475 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537818  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1662  response regulator  42.34 
 
 		 475 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0599  response regulator  42.34 
 
 		 475 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  34.33 
 
 		 557 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2722  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.94 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5575  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.15 
 
 		 472 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1716  response regulator  42.34 
 
 		 475 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5939  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.15 
 
 		 472 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.862183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2808  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 482 aa  82.8  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0745  response regulator/HD domain-containing protein  37.93 
 
 		 481 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 		 1465 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3971  putative GAF sensor protein  34.06 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.98 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6276  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.98 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0261  response regulator  39.58 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0972  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.09 
 
 		 994 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.172335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1569  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.73 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3805  response regulator receiver domain-containing protein  34.04 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2547  response regulator receiver protein  30.85 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4102  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1542  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150385  normal  0.319028 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0606  response regulator  37.21 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1766  response regulator receiver domain-containing protein  27.12 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.143421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4817  response regulator receiver modulated serine phosphatase with GAF sensor  34.25 
 
 		 553 aa  80.5  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2721  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0050  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.09 
 
 		 515 aa  79.3  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0532507 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0970  response regulator receiver  37.12 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1179  sigma-54 factor, interaction region  31.17 
 
 		 482 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0557788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1534  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 439 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2496  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 495 aa  79  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0534594  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3757  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2708  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 141 aa  77.4  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0523429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>