More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3729 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3729  response regulator receiver protein  100 
 
 		 323 aa  642    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.800159  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2812  response regulator receiver  43.97 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101507  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2738  response regulator transcription regulator protein  40.6 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2977  response regulator receiver protein  42.12 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2567  response regulator receiver protein  41.1 
 
 		 339 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1291  response regulator receiver protein  44.13 
 
 		 336 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127237  normal  0.0846123 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2949  response regulator receiver domain-containing protein  46.91 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2689  response regulator receiver domain-containing protein  44.04 
 
 		 339 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.579235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3060  response regulator receiver  46.05 
 
 		 410 aa  133  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1529  response regulator receiver  41.01 
 
 		 151 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3728  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.439666  normal  0.0786529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2813  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  43.41 
 
 		 1111 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2007  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 388 aa  95.9  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000116465  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2737  two component response regulator transcription regulator protein  36.14 
 
 		 374 aa  95.9  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4751  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 384 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259995  normal  0.0850645 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  37.06 
 
 		 1172 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4817  response regulator receiver modulated serine phosphatase with GAF sensor  35.8 
 
 		 553 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26830  putative two-component response regulator  43.9 
 
 		 303 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2793  two-component response regulator  37.86 
 
 		 154 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2689  response regulator  42.55 
 
 		 481 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0757  response regulator/HD domain-containing protein  42.55 
 
 		 481 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  37.84 
 
 		 1156 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2388  response regulator  42.55 
 
 		 481 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0923  response regulator  42.55 
 
 		 481 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  39.86 
 
 		 1180 aa  93.6  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2950  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 378 aa  93.6  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2469  response regulator  42.55 
 
 		 481 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1423  response regulator receiver (CheY) and GAF domain-containing protein  40.48 
 
 		 315 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2273  putative two-component response regulator  43.09 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.438912  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0261  response regulator  42.55 
 
 		 439 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0615  response regulator  42.55 
 
 		 484 aa  92.4  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.177724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3476  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 		 479 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0745  response regulator/HD domain-containing protein  41.84 
 
 		 481 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.34 
 
 		 473 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2566  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.236818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2976  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.598418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  36.57 
 
 		 557 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  44.68 
 
 		 622 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.68 
 
 		 622 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1404  response regulator receiver protein  36.69 
 
 		 154 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1569  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.16 
 
 		 452 aa  89.7  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0972  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.88 
 
 		 994 aa  89.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.172335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0050  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.02 
 
 		 515 aa  89.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0532507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.68 
 
 		 622 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2691  response regulator receiver domain-containing protein  39.13 
 
 		 134 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 469 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6276  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 469 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4317  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.02 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248315  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  37.14 
 
 		 557 aa  87.8  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6441  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.34 
 
 		 470 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5575  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.34 
 
 		 472 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2231  response regulator  39.6 
 
 		 475 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5939  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.34 
 
 		 472 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.862183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0970  response regulator receiver  38.81 
 
 		 438 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0731  response regulator  42.4 
 
 		 476 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0720  response regulator receiver, fis type  34.88 
 
 		 312 aa  86.7  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.935409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0711  response regulator  38.93 
 
 		 518 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1716  response regulator  38.93 
 
 		 475 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1662  response regulator  38.93 
 
 		 475 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0599  response regulator  38.93 
 
 		 475 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1923  response regulator  38.93 
 
 		 475 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537818  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2314  response regulator  38.93 
 
 		 475 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1525  ATP-binding region ATPase domain protein  33.8 
 
 		 359 aa  85.9  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3472  response regulator receiver domain-containing protein  34.94 
 
 		 187 aa  85.9  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1161  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.175427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.78 
 
 		 1355 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.38 
 
 		 628 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  34.31 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3805  response regulator receiver domain-containing protein  39.1 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1315  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1542  response regulator receiver domain-containing protein  38.93 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150385  normal  0.319028 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2012  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2367  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.52 
 
 		 538 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1766  response regulator receiver domain-containing protein  34.88 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.143421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  42.86 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.73 
 
 		 449 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247955  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1534  response regulator receiver protein  37.32 
 
 		 439 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2722  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.81 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2184  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 497 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.682977  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1289  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 134 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.295021  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1427  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03496  response regulator  31.79 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  34.39 
 
 		 543 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3971  putative GAF sensor protein  35.2 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2496  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0534594  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2392  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0507  HupR response regulator  38.24 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2158  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00791251  normal  0.142838 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2447  signal transduction protein  34.09 
 
 		 965 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.936876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4102  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1895  response regulator receiver protein  36.42 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.706146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2716  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.45 
 
 		 629 aa  79.7  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3375  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.62 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2547  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  39.01 
 
 		 456 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1570  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4550  response regulator receiver domain-containing protein  37.86 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2745  response regulator receiver protein  38.3 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2388  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 154 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.319662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>