39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4199 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4199  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 193 aa  380  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.335667  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  70.42 
 
 		 265 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  65.71 
 
 		 260 aa  175  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  64.08 
 
 		 275 aa  174  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  70.63 
 
 		 266 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  69.23 
 
 		 265 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  64.08 
 
 		 266 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  58.4 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  52.99 
 
 		 270 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  43.61 
 
 		 267 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  41.79 
 
 		 268 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  42.45 
 
 		 261 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  42.65 
 
 		 271 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  42.45 
 
 		 261 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  33.79 
 
 		 269 aa  88.6  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  39.73 
 
 		 270 aa  87  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  39.13 
 
 		 260 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  39.72 
 
 		 267 aa  85.1  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  37.68 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  35.86 
 
 		 271 aa  78.2  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  38.83 
 
 		 250 aa  77.8  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  32.89 
 
 		 269 aa  74.3  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  30.81 
 
 		 296 aa  64.7  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  30.22 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  30.47 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  33 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  29.13 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 		 342 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  33.33 
 
 		 342 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  28.71 
 
 		 345 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  33.83 
 
 		 288 aa  48.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  26.23 
 
 		 342 aa  47.8  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  31.33 
 
 		 342 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  26.62 
 
 		 332 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  29.55 
 
 		 283 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  31.46 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  28 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  29.32 
 
 		 282 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  34.04 
 
 		 295 aa  42  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>