128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3812 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3812  peptidase M50  100 
 
 		 224 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0990  peptidase M50  91.03 
 
 		 224 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0928  peptidase M50  57.6 
 
 		 223 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.882812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1924  peptidase M50  44.97 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.434385  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2747  peptidase M50  43.35 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1021  peptidase M50  39.89 
 
 		 196 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3494  peptidase M50  39.9 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.698821  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0055  hypothetical protein  36.11 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0133021 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0861  peptidase M50  38.5 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.100936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0830  peptidase M50  46 
 
 		 199 aa  113  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0058  peptidase M50  44.97 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643097  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0765  peptidase M50  42.95 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.249654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1624  peptidase M50  39.9 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0435  peptidase M50  45.78 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1153  peptidase M50  43.15 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.41947  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0156  peptidase M50  38.38 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1987  peptidase M50  38.83 
 
 		 198 aa  92.4  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2536  peptidase M50  34.57 
 
 		 208 aa  91.7  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0470  peptidase M50  34.84 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0075  peptidase M50  32.12 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0242  peptidase M50  33.66 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.989746 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1442  peptidase M50  32.32 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.535912  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0909  peptidase M50  30.64 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.470525  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2169  peptidase M50  32.48 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000408373 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0317  peptidase M50  34.44 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1308  peptidase M50  37.12 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  34.13 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  29.03 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  29.03 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0691  peptidase M50  36.69 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00130095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  31.82 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0775  peptidase M50  42.42 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  29.81 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  34.81 
 
 		 372 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  33.8 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  34.91 
 
 		 373 aa  52  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  35.03 
 
 		 372 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  32.69 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  34.48 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  29.38 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  31.34 
 
 		 390 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  29.08 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  31.98 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  31.71 
 
 		 286 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  30.28 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  33.08 
 
 		 392 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  30.68 
 
 		 364 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  30.5 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  34.62 
 
 		 366 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  30.28 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  29.79 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  29.79 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  29.79 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  27.27 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  31.51 
 
 		 375 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  26.96 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20920  Zn-dependent protease  31.45 
 
 		 380 aa  48.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.961375 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  28.22 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2551  peptidase M50  27.94 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00369558  normal  0.148044 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  28.22 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  27.45 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3219  peptidase M50  30.99 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  28.22 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  28.22 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  28.22 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  28.22 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  28.22 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  26 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  32.41 
 
 		 290 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  30.77 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  28.49 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  29.08 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  28.95 
 
 		 378 aa  45.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  28.28 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1142  integral membrane transmembrane protein  30.33 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2006  peptidase M50  29.84 
 
 		 376 aa  45.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  27.03 
 
 		 366 aa  45.4  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  31.13 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  29.14 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  30.16 
 
 		 361 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0791  peptidase M50  28.79 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  29.14 
 
 		 224 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  29.14 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  26.53 
 
 		 364 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  29.14 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  30 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 336 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 		 378 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  25.62 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1339  peptidase M50  27.81 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000024793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  29.23 
 
 		 368 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  32.47 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  29.14 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  30.2 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  29.14 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2389  M50 family peptidase  24.8 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  28.99 
 
 		 370 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  29.14 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  25.62 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  26.09 
 
 		 377 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0113637 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>