46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0156 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0156  peptidase M50  100 
 
 
207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1987  peptidase M50  73.06 
 
 
198 aa  254  9e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2536  peptidase M50  61.31 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0055  hypothetical protein  48.62 
 
 
230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0133021 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0075  peptidase M50  52.4 
 
 
212 aa  175  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.211405  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3494  peptidase M50  49.18 
 
 
209 aa  154  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.698821  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1624  peptidase M50  48.9 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0861  peptidase M50  45.16 
 
 
222 aa  143  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2747  peptidase M50  45.31 
 
 
213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0470  peptidase M50  39.18 
 
 
201 aa  124  7e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0765  peptidase M50  38.83 
 
 
200 aa  121  8e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.249654  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1153  peptidase M50  39.36 
 
 
200 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.41947  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0058  peptidase M50  39.36 
 
 
200 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643097  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0435  peptidase M50  42.27 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0830  peptidase M50  39.88 
 
 
199 aa  111  9e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1021  peptidase M50  37.7 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3812  peptidase M50  39.58 
 
 
224 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0990  peptidase M50  38.04 
 
 
224 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1924  peptidase M50  32.18 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.434385  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0928  peptidase M50  34.47 
 
 
223 aa  89  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.882812 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0775  peptidase M50  36.54 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1308  peptidase M50  34.16 
 
 
201 aa  82  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141861  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0242  peptidase M50  43.79 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.989746 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0909  peptidase M50  34.32 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.470525  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1442  peptidase M50  33.11 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.535912  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0317  peptidase M50  34.41 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2169  peptidase M50  34.42 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000408373 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0691  peptidase M50  33.52 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00130095 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  28.93 
 
 
218 aa  49.3  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  28.93 
 
 
225 aa  45.4  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  25.85 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0550  peptidase M50  42.62 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  29.33 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  27.43 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  27.46 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  29.71 
 
 
285 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4678  stage IV sporulation protein FB  32.5 
 
 
286 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0277771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4344  stage IV sporulation protein FB  32.5 
 
 
286 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  28.39 
 
 
226 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  28.57 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4565  stage IV sporulation protein FB  31.93 
 
 
286 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000384784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4580  stage IV sporulation protein FB  31.93 
 
 
286 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000567867  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  30.46 
 
 
221 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4538  stage IV sporulation protein FB  31.93 
 
 
286 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.214848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3427  peptidase M50  29.79 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  26.49 
 
 
222 aa  41.2  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>