148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0990 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0990  peptidase M50  100 
 
 
224 aa  435  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3812  peptidase M50  91.03 
 
 
224 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0928  peptidase M50  58.29 
 
 
223 aa  210  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.882812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1924  peptidase M50  45.5 
 
 
214 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.434385  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2747  peptidase M50  42.93 
 
 
213 aa  128  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3494  peptidase M50  39.38 
 
 
209 aa  116  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.698821  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0055  hypothetical protein  39.89 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0133021 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1021  peptidase M50  40.43 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0830  peptidase M50  44.44 
 
 
199 aa  113  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0765  peptidase M50  43.62 
 
 
200 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.249654  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0861  peptidase M50  37.77 
 
 
222 aa  112  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0435  peptidase M50  41 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1624  peptidase M50  38.86 
 
 
212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0058  peptidase M50  43.42 
 
 
200 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643097  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1153  peptidase M50  42.47 
 
 
200 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.41947  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0156  peptidase M50  36.41 
 
 
207 aa  92.8  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2536  peptidase M50  34.55 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0470  peptidase M50  36.77 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1987  peptidase M50  36.32 
 
 
198 aa  85.5  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0075  peptidase M50  32.32 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.211405  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0242  peptidase M50  34.48 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.989746 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1442  peptidase M50  32.53 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.535912  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0909  peptidase M50  33.08 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.470525  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2169  peptidase M50  32.05 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000408373 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0317  peptidase M50  36.43 
 
 
186 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0691  peptidase M50  36.36 
 
 
208 aa  58.9  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00130095 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1308  peptidase M50  33.96 
 
 
201 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141861  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  31.98 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  31.64 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  28.57 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  28.57 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 
343 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  31.07 
 
 
220 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  31.06 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  29.94 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0775  peptidase M50  42.42 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  35.71 
 
 
373 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  28.43 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  33.33 
 
 
286 aa  52.8  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  34.07 
 
 
372 aa  52  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  29.38 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  31.08 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  29.94 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  32.86 
 
 
375 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  29.94 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20920  Zn-dependent protease  34.29 
 
 
380 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.961375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  35.48 
 
 
392 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  29.94 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  29.5 
 
 
221 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2006  peptidase M50  29.75 
 
 
376 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  34.48 
 
 
228 aa  48.9  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  32.05 
 
 
224 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  29.5 
 
 
221 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  33.33 
 
 
372 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  30.95 
 
 
342 aa  48.5  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3219  peptidase M50  29.94 
 
 
223 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  33.1 
 
 
213 aa  48.5  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  33.1 
 
 
290 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  31.62 
 
 
390 aa  48.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  29.5 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  29.5 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  29.5 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  29.5 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  29.5 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  30.16 
 
 
338 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  30.16 
 
 
337 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  32.18 
 
 
378 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  31.29 
 
 
373 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  32.33 
 
 
375 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  33.59 
 
 
366 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  28.48 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  28.67 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  27.78 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  27.78 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  28.86 
 
 
378 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1818  peptidase M50  33.07 
 
 
302 aa  46.6  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  32.85 
 
 
336 aa  47  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  30.3 
 
 
368 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  32.03 
 
 
364 aa  46.6  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  27.22 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 
384 aa  46.2  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0801  peptidase M50  30.28 
 
 
216 aa  46.2  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  28.22 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  27.22 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  27.22 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  30.1 
 
 
220 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  27.22 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3065  peptidase M50  30.63 
 
 
237 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00942049  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  27.67 
 
 
260 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  27.67 
 
 
224 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  32.45 
 
 
207 aa  45.4  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  27.67 
 
 
224 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  26.28 
 
 
239 aa  45.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  31.06 
 
 
293 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  26.4 
 
 
222 aa  45.1  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2551  peptidase M50  28 
 
 
220 aa  45.1  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00369558  normal  0.148044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  28 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  28.4 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  26.47 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  24.53 
 
 
366 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>