40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1987 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1987  peptidase M50  100 
 
 
198 aa  387  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0156  peptidase M50  73.06 
 
 
207 aa  254  7e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2536  peptidase M50  59.69 
 
 
208 aa  208  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0075  peptidase M50  52.13 
 
 
212 aa  192  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.211405  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0055  hypothetical protein  48.85 
 
 
230 aa  188  4e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0133021 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3494  peptidase M50  44.97 
 
 
209 aa  136  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.698821  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2747  peptidase M50  45.05 
 
 
213 aa  134  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1624  peptidase M50  46.15 
 
 
212 aa  127  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0861  peptidase M50  43.96 
 
 
222 aa  123  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0435  peptidase M50  43.96 
 
 
212 aa  121  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0765  peptidase M50  38.3 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.249654  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1021  peptidase M50  42.66 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0058  peptidase M50  39.23 
 
 
200 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643097  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1153  peptidase M50  38.12 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.41947  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0830  peptidase M50  37.93 
 
 
199 aa  108  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0470  peptidase M50  40.43 
 
 
201 aa  108  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3812  peptidase M50  38.62 
 
 
224 aa  104  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0990  peptidase M50  36.32 
 
 
224 aa  97.8  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1924  peptidase M50  35.35 
 
 
214 aa  93.2  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.434385  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0928  peptidase M50  36.1 
 
 
223 aa  84  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.882812 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0909  peptidase M50  33.33 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.470525  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0775  peptidase M50  36.14 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1308  peptidase M50  33.5 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141861  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0242  peptidase M50  33.51 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.989746 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0317  peptidase M50  38.62 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2169  peptidase M50  33.54 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000408373 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1442  peptidase M50  29.66 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.535912  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0691  peptidase M50  31.43 
 
 
208 aa  58.2  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00130095 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  28.19 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  31.41 
 
 
218 aa  48.1  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3065  peptidase M50  28.21 
 
 
237 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00942049  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  29.03 
 
 
227 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  25 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  32.17 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  29.05 
 
 
222 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0550  peptidase M50  36.07 
 
 
204 aa  42.4  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  32.17 
 
 
221 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  28.36 
 
 
209 aa  41.6  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  34.16 
 
 
224 aa  41.6  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2032  peptidase M50  27.78 
 
 
226 aa  41.2  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.999243  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>