236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2457 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2457  purine phosphorylase family 1  100 
 
 		 262 aa  527  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.146261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2333  purine phosphorylase family 1  88.93 
 
 		 262 aa  445  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.323089 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2196  purine or other phosphorylase family 1  73.41 
 
 		 255 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3063  purine or other phosphorylase family 1  72.83 
 
 		 255 aa  374  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.592926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1216  purine or other phosphorylase family 1  65.73 
 
 		 256 aa  341  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2537  uridine phosphorylase  65 
 
 		 293 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0118959  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3074  uridine phosphorylase  40.55 
 
 		 252 aa  186  5e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0126681  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0460  uridine phosphorylase  41.15 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3932  uridine phosphorylase  43.81 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4352  uridine phosphorylase  42.67 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3403  uridine phosphorylase  41.15 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3505  uridine phosphorylase  39.37 
 
 		 252 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000185074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0447  uridine phosphorylase  39.37 
 
 		 252 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0162908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3680  uridine phosphorylase  39.37 
 
 		 252 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0823694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0412  uridine phosphorylase  41.59 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0491  uridine phosphorylase  41.15 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000989651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3852  uridine phosphorylase  41.15 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0543  uridine phosphorylase  41.15 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00257097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0488  uridine phosphorylase  41.15 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000843993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0467  uridine phosphorylase  41.15 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000270891  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4133  uridine phosphorylase  41.15 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0244  uridine phosphorylase  38.82 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5272  uridine phosphorylase  38.91 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.25692  normal  0.111968 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4352  uridine phosphorylase  38.91 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4303  uridine phosphorylase  38.91 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4177  uridine phosphorylase  38.91 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0246384 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4176  uridine phosphorylase  39.3 
 
 		 253 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.82731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4355  uridine phosphorylase  39.3 
 
 		 253 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4295  uridine phosphorylase  39.3 
 
 		 253 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4199  uridine phosphorylase  39.3 
 
 		 253 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4248  uridine phosphorylase  39.3 
 
 		 253 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4148  uridine phosphorylase  38.91 
 
 		 253 aa  178  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03667  hypothetical protein  38.91 
 
 		 253 aa  178  8e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4055  uridine phosphorylase  38.91 
 
 		 253 aa  178  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03718  uridine phosphorylase  38.91 
 
 		 254 aa  178  9e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4208  uridine phosphorylase  38.91 
 
 		 254 aa  178  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000492697 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3950  uridine phosphorylase  38.1 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3646  uridine phosphorylase  38.1 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4067  uridine phosphorylase  41.81 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4509  uridine phosphorylase  40.27 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3390  uridine phosphorylase  38.8 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000467764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0266  uridine phosphorylase  38.1 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2868  uridine phosphorylase  40.27 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0461  uridine phosphorylase  39.82 
 
 		 252 aa  175  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3962  uridine phosphorylase  37.74 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0187  uridine phosphorylase  39.92 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004006  uridine phosphorylase  38.49 
 
 		 252 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01516  uridine phosphorylase  38.1 
 
 		 283 aa  168  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1831  uridine phosphorylase  37.01 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0552  uridine phosphorylase  38.89 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1519  uridine phosphorylase  39.13 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1837  uridine phosphorylase  38.74 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.748158 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0392  uridine phosphorylase  38.43 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0403718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0469  uridine phosphorylase  38.4 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0396786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1597  uridine phosphorylase  37.55 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.585092 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0598  uridine phosphorylase  36.17 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1651  uridine phosphorylase  37.94 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0938  purine or other phosphorylase family 1  35.97 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.686275 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2738  purine or other phosphorylase family 1  32.52 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1240  uridine phosphorylase  35.68 
 
 		 290 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.719216  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1385  purine or other phosphorylase family 1  33.08 
 
 		 293 aa  125  9e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.534425  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2464  purine or other phosphorylase family 1  34.33 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0507  purine or other phosphorylase family 1  34.62 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2072  uridine phosphorylase  35.18 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00214406  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0370  uridine phosphorylase  32.38 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0375  uridine phosphorylase  32.38 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0754  uridine phosphorylase  34.1 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0818347  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1596  purine phosphorylases family protein 1  36.4 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0962  purine or other phosphorylase family 1  30.43 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3375  purine nucleoside phosphorylase  30.21 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.284651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  29.84 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3108  purine nucleoside phosphorylase  32.13 
 
 		 234 aa  102  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3546  purine nucleoside phosphorylase  30.21 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.799796  hitchhiker  0.000820133 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  32.13 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  32.03 
 
 		 241 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0544  purine or other phosphorylase family 1  33.6 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3045  purine nucleoside phosphorylase  30.21 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  31.6 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4137  uridine phosphorylase  31.03 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0606  purine-nucleoside phosphorylase  34.91 
 
 		 236 aa  99.4  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4122  uridine phosphorylase  30.54 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  31.19 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0060  purine phosphorylases family protein 1  32.39 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2812  purine nucleoside phosphorylase  29.36 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0651432  unclonable  0.00000308017 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2318  purine or other phosphorylase family 1  29.34 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0976  purine nucleoside phosphorylase  29.79 
 
 		 236 aa  96.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392055 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  31.52 
 
 		 242 aa  95.9  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2947  purine nucleoside phosphorylase  32.33 
 
 		 232 aa  95.9  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3363  purine nucleoside phosphorylase  30.21 
 
 		 236 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586668 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1221  purine nucleoside phosphorylase  29.79 
 
 		 236 aa  95.1  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1143  purine nucleoside phosphorylase  30.21 
 
 		 236 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000418679 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3224  purine nucleoside phosphorylase  30.21 
 
 		 236 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3227  purine nucleoside phosphorylase  30.21 
 
 		 236 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1546  purine phosphorylase family 1  33.18 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0539686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1040  purine nucleoside phosphorylase  29.36 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.540297  hitchhiker  0.00000698922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1105  purine nucleoside phosphorylase  29.36 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182057 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1044  purine nucleoside phosphorylase  29.36 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2819  purine nucleoside phosphorylase  29.79 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1005  purine nucleoside phosphorylase  29.36 
 
 		 236 aa  94  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.622952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2420  purine nucleoside phosphorylase  31.33 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>