237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2196 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2196  purine or other phosphorylase family 1  100 
 
 		 255 aa  517  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3063  purine or other phosphorylase family 1  81.96 
 
 		 255 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.592926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2333  purine phosphorylase family 1  74.37 
 
 		 262 aa  361  7.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.323089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2457  purine phosphorylase family 1  74.37 
 
 		 262 aa  356  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.146261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1216  purine or other phosphorylase family 1  64.92 
 
 		 256 aa  325  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2537  uridine phosphorylase  68 
 
 		 293 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0118959  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0460  uridine phosphorylase  42.42 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2868  uridine phosphorylase  39.37 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3074  uridine phosphorylase  41.56 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0126681  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0412  uridine phosphorylase  41.99 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3390  uridine phosphorylase  39.37 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000467764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0491  uridine phosphorylase  41.56 
 
 		 252 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000989651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3852  uridine phosphorylase  41.56 
 
 		 252 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0488  uridine phosphorylase  41.56 
 
 		 252 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000843993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0467  uridine phosphorylase  41.56 
 
 		 252 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000270891  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03718  uridine phosphorylase  40 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4208  uridine phosphorylase  40 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000492697 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4133  uridine phosphorylase  41.56 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4177  uridine phosphorylase  40 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0246384 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5272  uridine phosphorylase  40 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.25692  normal  0.111968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3505  uridine phosphorylase  41.56 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000185074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0447  uridine phosphorylase  41.56 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0162908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3403  uridine phosphorylase  41.13 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3680  uridine phosphorylase  41.56 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0823694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4352  uridine phosphorylase  40 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4303  uridine phosphorylase  40 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4148  uridine phosphorylase  40 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0461  uridine phosphorylase  41.13 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03667  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4055  uridine phosphorylase  40 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0543  uridine phosphorylase  41.56 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00257097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4509  uridine phosphorylase  40.69 
 
 		 252 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4352  uridine phosphorylase  42.17 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3950  uridine phosphorylase  39.6 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3646  uridine phosphorylase  39.6 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0266  uridine phosphorylase  39.6 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3932  uridine phosphorylase  40.16 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3962  uridine phosphorylase  39.6 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4248  uridine phosphorylase  39.6 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4199  uridine phosphorylase  39.6 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4295  uridine phosphorylase  39.6 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4355  uridine phosphorylase  39.6 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4176  uridine phosphorylase  39.6 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.82731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0244  uridine phosphorylase  38.8 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4067  uridine phosphorylase  41.37 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0187  uridine phosphorylase  40.48 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01516  uridine phosphorylase  36.65 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004006  uridine phosphorylase  37.1 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1831  uridine phosphorylase  37.6 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1519  uridine phosphorylase  38.58 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0552  uridine phosphorylase  37.45 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1837  uridine phosphorylase  39.36 
 
 		 261 aa  159  6e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.748158 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0392  uridine phosphorylase  37.61 
 
 		 275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0403718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1597  uridine phosphorylase  37.78 
 
 		 261 aa  151  8e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.585092 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1651  uridine phosphorylase  37.35 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0469  uridine phosphorylase  35.74 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0396786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0598  uridine phosphorylase  36.02 
 
 		 275 aa  140  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2738  purine or other phosphorylase family 1  32.18 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1385  purine or other phosphorylase family 1  33.74 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.534425  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0938  purine or other phosphorylase family 1  33.33 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.686275 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2464  purine or other phosphorylase family 1  33.33 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0507  purine or other phosphorylase family 1  34.22 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1240  uridine phosphorylase  32.11 
 
 		 290 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.719216  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4137  uridine phosphorylase  31.22 
 
 		 247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4122  uridine phosphorylase  30.73 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  32.74 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0375  uridine phosphorylase  31.17 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0370  uridine phosphorylase  31.17 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2072  uridine phosphorylase  32.13 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00214406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  29.34 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0754  uridine phosphorylase  30.28 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0818347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0544  purine or other phosphorylase family 1  33.87 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  30.99 
 
 		 244 aa  98.6  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0962  purine or other phosphorylase family 1  26.91 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3375  purine nucleoside phosphorylase  30.6 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.284651 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  29.01 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  30.27 
 
 		 241 aa  96.3  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2072  purine or other phosphorylase family 1  31.12 
 
 		 240 aa  95.9  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1187  purine nucleoside phosphorylase  31.06 
 
 		 235 aa  95.9  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1518  purine nucleoside phosphorylase  29.91 
 
 		 235 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1588  purine nucleoside phosphorylase  30.64 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0326912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3827  purine nucleoside phosphorylase  30.64 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000284162 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1372  purine nucleoside phosphorylase  30.64 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.896759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1345  purine nucleoside phosphorylase  30.64 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1344  purine nucleoside phosphorylase  30.64 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1483  purine nucleoside phosphorylase  30.64 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1624  purine nucleoside phosphorylase  30.64 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0606  purine-nucleoside phosphorylase  32.26 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1555  purine nucleoside phosphorylase  30.64 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000650002 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1386  purine nucleoside phosphorylase  30.64 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  30.28 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  28.24 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3624  purine nucleoside phosphorylase  31.54 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0060  purine phosphorylases family protein 1  31.64 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2947  purine nucleoside phosphorylase  33.91 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3495  purine nucleoside phosphorylase  31.54 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  31.12 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4926  purine nucleoside phosphorylase  30.86 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4978  purine nucleoside phosphorylase  30.86 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0536  purine phosphorylase family 1  29.93 
 
 		 330 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>