154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0536 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0536  purine phosphorylase family 1  100 
 
 		 330 aa  656    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1663  phosphorylase family protein  69.03 
 
 		 323 aa  435  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00359736  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1592  purine or other phosphorylase family 1  46.49 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2180  purine or other phosphorylase family 1  33.01 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.463347  normal  0.439146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4693  purine or other phosphorylase family 1  35.13 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  hitchhiker  0.00640457 
 
 
-
 
NC_002950  PG1371  phosphorylase family protein  33.55 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.211182 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1371  hypothetical protein  33.11 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1367  hypothetical protein  32.53 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1827  purine or other phosphorylase family 1  34.01 
 
 		 289 aa  126  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6506  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2837  purine phosphorylase family 1  30.45 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.716024  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10958  phosphorylase family protein  31.65 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.654381  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2464  purine or other phosphorylase family 1  28.99 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2196  purine or other phosphorylase family 1  29.93 
 
 		 255 aa  93.2  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0392  uridine phosphorylase  31.36 
 
 		 275 aa  92.4  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0403718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2738  purine or other phosphorylase family 1  30.03 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1385  purine or other phosphorylase family 1  27.39 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.534425  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0938  purine or other phosphorylase family 1  26.95 
 
 		 275 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.686275 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0598  uridine phosphorylase  26.94 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1216  purine or other phosphorylase family 1  28.05 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3063  purine or other phosphorylase family 1  29.04 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.592926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1651  uridine phosphorylase  29.93 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0507  purine or other phosphorylase family 1  26.86 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1837  uridine phosphorylase  27.21 
 
 		 261 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.748158 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1831  uridine phosphorylase  26.18 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0126  purine phosphorylases family protein 1  29.13 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03718  uridine phosphorylase  28 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4148  uridine phosphorylase  28 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03667  hypothetical protein  28 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5272  uridine phosphorylase  28 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.25692  normal  0.111968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4055  uridine phosphorylase  28 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4352  uridine phosphorylase  28 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4303  uridine phosphorylase  28 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4177  uridine phosphorylase  28 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0246384 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4208  uridine phosphorylase  28 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000492697 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1597  uridine phosphorylase  28.52 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.585092 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0469  uridine phosphorylase  27.46 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0396786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3962  uridine phosphorylase  27.57 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4176  uridine phosphorylase  27.91 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.82731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1578  purine phosphorylase family 1  29.47 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00464289 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2333  purine phosphorylase family 1  27.15 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.323089 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4295  uridine phosphorylase  27.91 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4199  uridine phosphorylase  27.91 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4248  uridine phosphorylase  27.91 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4355  uridine phosphorylase  27.91 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1240  uridine phosphorylase  26.47 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.719216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2457  purine phosphorylase family 1  28.88 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.146261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2868  uridine phosphorylase  26.25 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01516  uridine phosphorylase  25.44 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3074  uridine phosphorylase  25.67 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0126681  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0460  uridine phosphorylase  25.67 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3932  uridine phosphorylase  27.91 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0266  uridine phosphorylase  28.36 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3646  uridine phosphorylase  28.36 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3950  uridine phosphorylase  28.36 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0552  uridine phosphorylase  26.43 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0461  uridine phosphorylase  25.66 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3403  uridine phosphorylase  25.33 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004006  uridine phosphorylase  25.45 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4352  uridine phosphorylase  27.91 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3390  uridine phosphorylase  25.33 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000467764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0244  uridine phosphorylase  27.64 
 
 		 253 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4509  uridine phosphorylase  24.58 
 
 		 252 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2537  uridine phosphorylase  27.51 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0118959  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2072  purine or other phosphorylase family 1  25.99 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0412  uridine phosphorylase  26.98 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4133  uridine phosphorylase  24.33 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3505  uridine phosphorylase  25.18 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000185074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0447  uridine phosphorylase  25.18 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0162908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3680  uridine phosphorylase  25.18 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0823694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3852  uridine phosphorylase  24 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0467  uridine phosphorylase  24 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000270891  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0491  uridine phosphorylase  24 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000989651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0488  uridine phosphorylase  24 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000843993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0187  uridine phosphorylase  27.39 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0543  uridine phosphorylase  24.33 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00257097  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0520  purine or other phosphorylase family 1  28.09 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0971  purine nucleoside phosphorylase  25.24 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4067  uridine phosphorylase  27.27 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1318  purine nucleoside phosphorylase  25.85 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000021408  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0060  purine phosphorylases family protein 1  30.48 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0375  uridine phosphorylase  25.53 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0370  uridine phosphorylase  25.53 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  22.55 
 
 		 259 aa  57  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2072  uridine phosphorylase  24.25 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00214406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3488  purine phosphorylase family protein 1  28.17 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1519  uridine phosphorylase  25.91 
 
 		 252 aa  54.3  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1668  purine or other phosphorylase family 1  35 
 
 		 253 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.279636  normal  0.215972 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0900  uridine phosphorylase  32.74 
 
 		 238 aa  52.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.768164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1518  purine nucleoside phosphorylase  25.58 
 
 		 235 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0962  purine or other phosphorylase family 1  31.97 
 
 		 263 aa  52.8  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1588  purine nucleoside phosphorylase  25.58 
 
 		 235 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0326912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1372  purine nucleoside phosphorylase  25.58 
 
 		 235 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.896759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1345  purine nucleoside phosphorylase  25.58 
 
 		 235 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1483  purine nucleoside phosphorylase  25.58 
 
 		 235 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3827  purine nucleoside phosphorylase  25.58 
 
 		 235 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000284162 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  25.73 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1555  purine nucleoside phosphorylase  25.58 
 
 		 235 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000650002 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1624  purine nucleoside phosphorylase  25.58 
 
 		 235 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1386  purine nucleoside phosphorylase  25.58 
 
 		 235 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0092  purine nucleoside phosphorylase  28.21 
 
 		 236 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>