252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0092 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0092  purine nucleoside phosphorylase  100 
 
 		 236 aa  488  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0083  purine nucleoside phosphorylase  59.32 
 
 		 245 aa  306  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0506882  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001249  purine nucleoside phosphorylase  58.47 
 
 		 236 aa  302  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.328135  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05118  purine nucleoside phosphorylase  58.47 
 
 		 236 aa  301  6.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4824  purine nucleoside phosphorylase  57.69 
 
 		 239 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4926  purine nucleoside phosphorylase  57.69 
 
 		 239 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4892  purine nucleoside phosphorylase  57.69 
 
 		 239 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4985  purine nucleoside phosphorylase  57.69 
 
 		 239 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4978  purine nucleoside phosphorylase  57.26 
 
 		 239 aa  298  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04260  purine nucleoside phosphorylase  56.84 
 
 		 239 aa  297  8e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3672  purine nucleoside phosphorylase  56.84 
 
 		 239 aa  297  8e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.398843 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04226  hypothetical protein  56.84 
 
 		 239 aa  297  8e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3614  purine nucleoside phosphorylase  56.41 
 
 		 239 aa  296  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5899  purine nucleoside phosphorylase  56.41 
 
 		 239 aa  296  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4619  purine nucleoside phosphorylase  56.41 
 
 		 239 aa  296  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4933  purine nucleoside phosphorylase  56.41 
 
 		 239 aa  296  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3449  purine nucleoside phosphorylase  56.84 
 
 		 241 aa  296  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4931  purine nucleoside phosphorylase  56.41 
 
 		 239 aa  296  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4983  purine nucleoside phosphorylase  56.41 
 
 		 239 aa  296  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3330  purine nucleoside phosphorylase  56.84 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0817178  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3495  purine nucleoside phosphorylase  55.56 
 
 		 239 aa  293  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0824  purine nucleoside phosphorylase  55.13 
 
 		 239 aa  294  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.02467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0663  purine nucleoside phosphorylase  55.46 
 
 		 243 aa  293  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3624  purine nucleoside phosphorylase  55.56 
 
 		 239 aa  293  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0544  purine nucleoside phosphorylase  55.74 
 
 		 240 aa  292  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.353867  normal  0.0917006 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0602  purine nucleoside phosphorylase  54.7 
 
 		 239 aa  292  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0828  purine nucleoside phosphorylase  55.13 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0288  purine nucleoside phosphorylase  54.31 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.324122  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1028  purine nucleoside phosphorylase  57.2 
 
 		 236 aa  285  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.263223  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0457  purine nucleoside phosphorylase  55.08 
 
 		 236 aa  284  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3612  purine nucleoside phosphorylase  54.66 
 
 		 236 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3884  purine nucleoside phosphorylase  58.95 
 
 		 236 aa  279  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000380041 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1040  purine nucleoside phosphorylase  55.93 
 
 		 236 aa  278  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.540297  hitchhiker  0.00000698922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1105  purine nucleoside phosphorylase  55.93 
 
 		 236 aa  278  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182057 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1044  purine nucleoside phosphorylase  55.93 
 
 		 236 aa  278  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179251 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0976  purine nucleoside phosphorylase  55.93 
 
 		 236 aa  278  7e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392055 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2819  purine nucleoside phosphorylase  55.51 
 
 		 236 aa  277  9e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1221  purine nucleoside phosphorylase  55.51 
 
 		 236 aa  277  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1143  purine nucleoside phosphorylase  55.51 
 
 		 236 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000418679 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3227  purine nucleoside phosphorylase  55.51 
 
 		 236 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3224  purine nucleoside phosphorylase  55.51 
 
 		 236 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3363  purine nucleoside phosphorylase  55.51 
 
 		 236 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586668 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1005  purine nucleoside phosphorylase  54.66 
 
 		 236 aa  275  5e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.622952  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002632  purine nucleoside phosphorylase  52.56 
 
 		 239 aa  275  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3546  purine nucleoside phosphorylase  52.54 
 
 		 236 aa  271  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.799796  hitchhiker  0.000820133 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1926  purine nucleoside phosphorylase  52.56 
 
 		 241 aa  271  6e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3375  purine nucleoside phosphorylase  52.54 
 
 		 236 aa  271  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.284651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2812  purine nucleoside phosphorylase  53.81 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0651432  unclonable  0.00000308017 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03374  purine nucleoside phosphorylase  53.42 
 
 		 269 aa  270  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2864  purine nucleoside phosphorylase  53.85 
 
 		 236 aa  269  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.304471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3045  purine nucleoside phosphorylase  53.81 
 
 		 236 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0635  purine nucleoside phosphorylase  55.9 
 
 		 236 aa  268  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0828  purine-nucleoside phosphorylase  52.34 
 
 		 243 aa  265  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1978  purine nucleoside phosphorylase  48.29 
 
 		 234 aa  249  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331725  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1187  purine nucleoside phosphorylase  51.52 
 
 		 235 aa  248  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1344  purine nucleoside phosphorylase  50.65 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1518  purine nucleoside phosphorylase  50.22 
 
 		 235 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3827  purine nucleoside phosphorylase  50.22 
 
 		 235 aa  244  6e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000284162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1588  purine nucleoside phosphorylase  50.22 
 
 		 235 aa  244  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0326912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1386  purine nucleoside phosphorylase  50.22 
 
 		 235 aa  244  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1372  purine nucleoside phosphorylase  50.22 
 
 		 235 aa  244  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.896759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1345  purine nucleoside phosphorylase  50.22 
 
 		 235 aa  244  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1483  purine nucleoside phosphorylase  50.22 
 
 		 235 aa  244  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1555  purine nucleoside phosphorylase  50.22 
 
 		 235 aa  244  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000650002 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1624  purine nucleoside phosphorylase  50.22 
 
 		 235 aa  244  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2420  purine nucleoside phosphorylase  51.95 
 
 		 236 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1863  purine nucleoside phosphorylase  51.29 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0203  purine nucleoside phosphorylase  49.79 
 
 		 235 aa  241  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0510  purine nucleoside phosphorylase  47.86 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0231  purine nucleoside phosphorylase  48.5 
 
 		 235 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.691256  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3422  purine nucleoside phosphorylase  49.78 
 
 		 234 aa  235  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6136  purine nucleoside phosphorylase  47.86 
 
 		 235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3271  purine nucleoside phosphorylase  48.05 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2947  purine nucleoside phosphorylase  48.26 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2832  purine nucleoside phosphorylase  48.73 
 
 		 235 aa  233  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3784  purine nucleoside phosphorylase  48.5 
 
 		 234 aa  232  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1925  purine nucleoside phosphorylase  46.35 
 
 		 235 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1838  purine nucleoside phosphorylase  47.41 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.336588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1657  purine nucleoside phosphorylase  47.84 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0417756  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2719  purine nucleoside phosphorylase  48.28 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1318  purine nucleoside phosphorylase  47.6 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000021408  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1652  purine nucleoside phosphorylase  47.41 
 
 		 235 aa  228  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000543003  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1391  purine nucleoside phosphorylase  47.41 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000867516  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2503  purine nucleoside phosphorylase  47.84 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.263795  hitchhiker  0.000530536 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1497  purine nucleoside phosphorylase  44.83 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1513  purine-nucleoside phosphorylase  46.61 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0821603  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0295  purine nucleoside phosphorylase  48.5 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0752  purine nucleoside phosphorylase  48.05 
 
 		 238 aa  223  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1003  purine nucleoside phosphorylase  46.15 
 
 		 234 aa  221  8e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00510571  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0799  purine nucleoside phosphorylase  47.23 
 
 		 234 aa  218  7.999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.467388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1793  purine nucleoside phosphorylase  44.3 
 
 		 232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000806796  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0122  purine nucleoside phosphorylase  46.96 
 
 		 235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000853984  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0127  purine nucleoside phosphorylase  46.96 
 
 		 235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.391631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3381  purine nucleoside phosphorylase  44.02 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336963  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0114  purine nucleoside phosphorylase  46.81 
 
 		 236 aa  211  9e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000527057  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3108  purine nucleoside phosphorylase  43.16 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1072  purine nucleoside phosphorylase  46.32 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.79397  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2858  purine nucleoside phosphorylase  44.83 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0463  purine nucleoside phosphorylase  43.91 
 
 		 233 aa  197  7.999999999999999e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0259121  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1747  purine nucleoside phosphorylase  43.78 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>