251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3390 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3390  uridine phosphorylase  100 
 
 		 252 aa  521  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000467764  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4133  uridine phosphorylase  94.05 
 
 		 252 aa  497  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0467  uridine phosphorylase  94.05 
 
 		 252 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0488  uridine phosphorylase  94.05 
 
 		 252 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000843993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3505  uridine phosphorylase  94.05 
 
 		 252 aa  497  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000185074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0447  uridine phosphorylase  94.05 
 
 		 252 aa  497  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0162908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3680  uridine phosphorylase  94.05 
 
 		 252 aa  497  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0823694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0491  uridine phosphorylase  94.05 
 
 		 252 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000989651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3852  uridine phosphorylase  94.05 
 
 		 252 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0460  uridine phosphorylase  92.86 
 
 		 252 aa  494  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0543  uridine phosphorylase  93.65 
 
 		 252 aa  495  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00257097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4509  uridine phosphorylase  92.06 
 
 		 252 aa  488  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3074  uridine phosphorylase  90.87 
 
 		 252 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0126681  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3403  uridine phosphorylase  91.27 
 
 		 252 aa  484  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0461  uridine phosphorylase  90.08 
 
 		 252 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0412  uridine phosphorylase  90.48 
 
 		 252 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2868  uridine phosphorylase  86.11 
 
 		 252 aa  464  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0266  uridine phosphorylase  76 
 
 		 253 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0187  uridine phosphorylase  75.79 
 
 		 252 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3950  uridine phosphorylase  76 
 
 		 253 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3646  uridine phosphorylase  76 
 
 		 253 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03718  uridine phosphorylase  75.6 
 
 		 254 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5272  uridine phosphorylase  75.6 
 
 		 253 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.25692  normal  0.111968 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4148  uridine phosphorylase  75.6 
 
 		 253 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4355  uridine phosphorylase  76 
 
 		 253 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4177  uridine phosphorylase  75.6 
 
 		 253 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0246384 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03667  hypothetical protein  75.6 
 
 		 253 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4199  uridine phosphorylase  76 
 
 		 253 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4208  uridine phosphorylase  75.6 
 
 		 254 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000492697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4352  uridine phosphorylase  75.6 
 
 		 253 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4176  uridine phosphorylase  76 
 
 		 253 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.82731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4248  uridine phosphorylase  76 
 
 		 253 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4303  uridine phosphorylase  75.6 
 
 		 253 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4295  uridine phosphorylase  76 
 
 		 253 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3932  uridine phosphorylase  74.9 
 
 		 253 aa  401  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4055  uridine phosphorylase  75.6 
 
 		 253 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0244  uridine phosphorylase  74.8 
 
 		 253 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004006  uridine phosphorylase  73.79 
 
 		 252 aa  397  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4352  uridine phosphorylase  74.1 
 
 		 256 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3962  uridine phosphorylase  74.8 
 
 		 253 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0552  uridine phosphorylase  74.6 
 
 		 258 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4067  uridine phosphorylase  74.1 
 
 		 256 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01516  uridine phosphorylase  73.79 
 
 		 283 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1831  uridine phosphorylase  71.37 
 
 		 252 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1519  uridine phosphorylase  68.65 
 
 		 252 aa  363  1e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3063  purine or other phosphorylase family 1  41.73 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.592926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1216  purine or other phosphorylase family 1  39.22 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2196  purine or other phosphorylase family 1  39.37 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1240  uridine phosphorylase  40.42 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.719216  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0392  uridine phosphorylase  41.41 
 
 		 275 aa  179  4.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0403718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0938  purine or other phosphorylase family 1  39.18 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.686275 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1597  uridine phosphorylase  43.54 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.585092 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2537  uridine phosphorylase  38.19 
 
 		 293 aa  175  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0118959  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2738  purine or other phosphorylase family 1  39.13 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0598  uridine phosphorylase  38.63 
 
 		 275 aa  171  6.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1385  purine or other phosphorylase family 1  39.04 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.534425  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0754  uridine phosphorylase  35.6 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0818347  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2333  purine phosphorylase family 1  38.94 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.323089 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0370  uridine phosphorylase  40.98 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2464  purine or other phosphorylase family 1  39.17 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0469  uridine phosphorylase  40.54 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0396786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2457  purine phosphorylase family 1  40.71 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.146261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2072  uridine phosphorylase  37.23 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00214406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0375  uridine phosphorylase  40.49 
 
 		 261 aa  165  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1837  uridine phosphorylase  41.47 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.748158 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2318  purine or other phosphorylase family 1  36.51 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0507  purine or other phosphorylase family 1  37.66 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1651  uridine phosphorylase  42.11 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0962  purine or other phosphorylase family 1  35.43 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  34.71 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  35.42 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4137  uridine phosphorylase  33.87 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  33.62 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4122  uridine phosphorylase  33.47 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  34.44 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  33.8 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  31.71 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0544  purine or other phosphorylase family 1  36.18 
 
 		 248 aa  135  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  33.63 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0004  uridine phosphorylase  33.93 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000523211  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3488  purine phosphorylase family protein 1  36.41 
 
 		 241 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  33.64 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0550  purine or other phosphorylase family 1  34.07 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3794  purine phosphorylases family protein 1  34.07 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3654  uridine phosphorylase  33.77 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4297  uridine phosphorylase, putative  36.41 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4885  purine or other phosphorylase family 1  37.88 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.620121  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000334  N-Ribosylnicotinamide phosphorylase  31.84 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00958039  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0520  purine or other phosphorylase family 1  34.01 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1596  purine phosphorylases family protein 1  34.65 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0900  uridine phosphorylase  29.91 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.768164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2072  purine or other phosphorylase family 1  33.01 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0606  purine-nucleoside phosphorylase  33.99 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2947  purine nucleoside phosphorylase  32.83 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0060  purine phosphorylases family protein 1  32.98 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1578  purine phosphorylase family 1  29.58 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00464289 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1081  purine or other phosphorylase family 1  28.5 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2832  purine nucleoside phosphorylase  34.01 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1497  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0126  purine phosphorylases family protein 1  29.86 
 
 		 242 aa  99.4  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>