More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0754 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0754  uridine phosphorylase  100 
 
 
250 aa  511  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0818347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0375  uridine phosphorylase  65.31 
 
 
261 aa  328  6e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0370  uridine phosphorylase  64.49 
 
 
261 aa  326  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2072  uridine phosphorylase  62.04 
 
 
259 aa  313  9.999999999999999e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00214406  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0962  purine or other phosphorylase family 1  50.62 
 
 
263 aa  256  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  52.24 
 
 
271 aa  252  5.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0544  purine or other phosphorylase family 1  49.19 
 
 
248 aa  236  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0598  uridine phosphorylase  48.02 
 
 
275 aa  205  7e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1240  uridine phosphorylase  44.62 
 
 
290 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.719216  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0469  uridine phosphorylase  44.98 
 
 
261 aa  187  1e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0396786  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03718  uridine phosphorylase  38.58 
 
 
254 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4208  uridine phosphorylase  38.58 
 
 
254 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000492697 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1837  uridine phosphorylase  44.58 
 
 
261 aa  186  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.748158 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4352  uridine phosphorylase  38.34 
 
 
253 aa  185  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4303  uridine phosphorylase  38.34 
 
 
253 aa  185  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5272  uridine phosphorylase  38.34 
 
 
253 aa  185  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.25692  normal  0.111968 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4177  uridine phosphorylase  38.34 
 
 
253 aa  185  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0246384 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4148  uridine phosphorylase  38.34 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4055  uridine phosphorylase  38.34 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03667  hypothetical protein  38.34 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  45.59 
 
 
242 aa  183  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3950  uridine phosphorylase  38.74 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3646  uridine phosphorylase  38.74 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0266  uridine phosphorylase  38.74 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1597  uridine phosphorylase  42.57 
 
 
261 aa  182  6e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.585092 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  44.76 
 
 
259 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0244  uridine phosphorylase  38.34 
 
 
253 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3962  uridine phosphorylase  38.34 
 
 
253 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4248  uridine phosphorylase  37.94 
 
 
253 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4295  uridine phosphorylase  37.94 
 
 
253 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4199  uridine phosphorylase  37.94 
 
 
253 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1651  uridine phosphorylase  42.97 
 
 
258 aa  180  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4176  uridine phosphorylase  37.94 
 
 
253 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.82731  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4355  uridine phosphorylase  37.94 
 
 
253 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597183  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1385  purine or other phosphorylase family 1  42.61 
 
 
293 aa  178  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.534425  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2738  purine or other phosphorylase family 1  43.18 
 
 
272 aa  176  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0392  uridine phosphorylase  41.67 
 
 
275 aa  175  7e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0403718  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0552  uridine phosphorylase  37.45 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  42.86 
 
 
242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2868  uridine phosphorylase  38 
 
 
252 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3505  uridine phosphorylase  36.95 
 
 
252 aa  171  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000185074  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0447  uridine phosphorylase  36.95 
 
 
252 aa  171  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0162908  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3680  uridine phosphorylase  36.95 
 
 
252 aa  171  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0823694  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4133  uridine phosphorylase  36.95 
 
 
252 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0543  uridine phosphorylase  36.95 
 
 
252 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00257097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004006  uridine phosphorylase  37.25 
 
 
252 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0491  uridine phosphorylase  36.95 
 
 
252 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000989651  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0938  purine or other phosphorylase family 1  44.29 
 
 
275 aa  170  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.686275 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0467  uridine phosphorylase  36.95 
 
 
252 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000270891  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1519  uridine phosphorylase  37.4 
 
 
252 aa  170  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4067  uridine phosphorylase  37.15 
 
 
256 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3403  uridine phosphorylase  37.25 
 
 
252 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01516  uridine phosphorylase  36.84 
 
 
283 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4509  uridine phosphorylase  36 
 
 
252 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0488  uridine phosphorylase  36.95 
 
 
252 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000843993  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3852  uridine phosphorylase  36.95 
 
 
252 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3390  uridine phosphorylase  35.6 
 
 
252 aa  169  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000467764  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2464  purine or other phosphorylase family 1  41.56 
 
 
278 aa  169  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3074  uridine phosphorylase  36.4 
 
 
252 aa  168  7e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0126681  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0460  uridine phosphorylase  35.6 
 
 
252 aa  168  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4352  uridine phosphorylase  36.36 
 
 
256 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0412  uridine phosphorylase  38.39 
 
 
252 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0461  uridine phosphorylase  35.6 
 
 
252 aa  165  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137715  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  40.65 
 
 
244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1831  uridine phosphorylase  36.44 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0187  uridine phosphorylase  36 
 
 
252 aa  161  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  41.67 
 
 
241 aa  160  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0507  purine or other phosphorylase family 1  39.68 
 
 
274 aa  160  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2318  purine or other phosphorylase family 1  36.44 
 
 
241 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3932  uridine phosphorylase  35.2 
 
 
253 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  35.04 
 
 
262 aa  155  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0550  purine or other phosphorylase family 1  41.12 
 
 
244 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3794  purine phosphorylases family protein 1  41.12 
 
 
244 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4137  uridine phosphorylase  39.81 
 
 
247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4122  uridine phosphorylase  39.32 
 
 
247 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  40.98 
 
 
243 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2072  purine or other phosphorylase family 1  37.96 
 
 
240 aa  143  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000334  N-Ribosylnicotinamide phosphorylase  37.7 
 
 
243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00958039  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3488  purine phosphorylase family protein 1  37.5 
 
 
241 aa  138  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0004  uridine phosphorylase  38 
 
 
243 aa  135  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000523211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3654  uridine phosphorylase  36.1 
 
 
243 aa  135  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0900  uridine phosphorylase  36.59 
 
 
238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.768164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4297  uridine phosphorylase, putative  37.98 
 
 
241 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0060  purine phosphorylases family protein 1  38.54 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1596  purine phosphorylases family protein 1  35.51 
 
 
238 aa  128  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1081  purine or other phosphorylase family 1  30.81 
 
 
252 aa  126  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1546  purine phosphorylase family 1  34.86 
 
 
238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0539686  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4885  purine or other phosphorylase family 1  36.92 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.620121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0606  purine-nucleoside phosphorylase  38.65 
 
 
236 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0520  purine or other phosphorylase family 1  34.74 
 
 
236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1578  purine phosphorylase family 1  33.8 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00464289 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0126  purine phosphorylases family protein 1  37.04 
 
 
242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1793  purine nucleoside phosphorylase  34.43 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000806796  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0910  purine or other phosphorylase family 1  32.26 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303015  normal  0.357288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6136  purine nucleoside phosphorylase  31.98 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0295  purine nucleoside phosphorylase  33.2 
 
 
232 aa  113  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0748  uridine phosphorylase  33.6 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1217  phosphorylase family protein  33.6 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1216  purine or other phosphorylase family 1  31.78 
 
 
256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1652  purine nucleoside phosphorylase  34.02 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000543003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>