265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3108 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008043  TM1040_3108  purine nucleoside phosphorylase  100 
 
 
234 aa  482  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0799  purine nucleoside phosphorylase  73.93 
 
 
234 aa  357  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.467388  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2858  purine nucleoside phosphorylase  74.79 
 
 
234 aa  347  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1513  purine-nucleoside phosphorylase  56.78 
 
 
243 aa  276  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0821603  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2420  purine nucleoside phosphorylase  55.79 
 
 
236 aa  275  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1518  purine nucleoside phosphorylase  54.94 
 
 
235 aa  270  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1344  purine nucleoside phosphorylase  54.51 
 
 
235 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1588  purine nucleoside phosphorylase  54.51 
 
 
235 aa  268  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0326912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1372  purine nucleoside phosphorylase  54.51 
 
 
235 aa  268  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.896759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1345  purine nucleoside phosphorylase  54.51 
 
 
235 aa  268  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1483  purine nucleoside phosphorylase  54.51 
 
 
235 aa  268  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3827  purine nucleoside phosphorylase  54.51 
 
 
235 aa  268  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000284162 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1555  purine nucleoside phosphorylase  54.51 
 
 
235 aa  268  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000650002 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1386  purine nucleoside phosphorylase  54.51 
 
 
235 aa  268  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1624  purine nucleoside phosphorylase  54.51 
 
 
235 aa  268  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1391  purine nucleoside phosphorylase  52.79 
 
 
235 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000867516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1318  purine nucleoside phosphorylase  53.02 
 
 
233 aa  267  8e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000021408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1187  purine nucleoside phosphorylase  54.08 
 
 
235 aa  267  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1652  purine nucleoside phosphorylase  52.36 
 
 
235 aa  267  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000543003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1863  purine nucleoside phosphorylase  52.79 
 
 
235 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2832  purine nucleoside phosphorylase  55.56 
 
 
235 aa  261  8e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1978  purine nucleoside phosphorylase  50.86 
 
 
234 aa  259  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331725  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3495  purine nucleoside phosphorylase  50.86 
 
 
239 aa  257  8e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3624  purine nucleoside phosphorylase  50.86 
 
 
239 aa  257  8e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0602  purine nucleoside phosphorylase  51.29 
 
 
239 aa  257  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0203  purine nucleoside phosphorylase  51.91 
 
 
235 aa  257  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0824  purine nucleoside phosphorylase  51.29 
 
 
239 aa  256  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.02467  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6136  purine nucleoside phosphorylase  53.91 
 
 
235 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0828  purine nucleoside phosphorylase  50.43 
 
 
239 aa  254  6e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3614  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4933  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857632  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4931  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5899  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4619  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4983  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3672  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.398843 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04260  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04226  hypothetical protein  50 
 
 
239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3375  purine nucleoside phosphorylase  51.95 
 
 
236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.284651 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3546  purine nucleoside phosphorylase  51.52 
 
 
236 aa  249  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.799796  hitchhiker  0.000820133 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3449  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
241 aa  248  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4926  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
239 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416667  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4985  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
239 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4892  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
239 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4824  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
239 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2864  purine nucleoside phosphorylase  51.5 
 
 
236 aa  247  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.304471  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3330  purine nucleoside phosphorylase  49.14 
 
 
241 aa  246  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0817178  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0976  purine nucleoside phosphorylase  50.86 
 
 
236 aa  246  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392055 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4978  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
239 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1005  purine nucleoside phosphorylase  50.86 
 
 
236 aa  245  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.622952  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2812  purine nucleoside phosphorylase  51.08 
 
 
236 aa  245  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0651432  unclonable  0.00000308017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0231  purine nucleoside phosphorylase  51.74 
 
 
235 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.691256  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0544  purine nucleoside phosphorylase  50.64 
 
 
240 aa  245  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.353867  normal  0.0917006 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3045  purine nucleoside phosphorylase  50.65 
 
 
236 aa  244  9e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0463  purine nucleoside phosphorylase  51.28 
 
 
233 aa  244  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0259121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2819  purine nucleoside phosphorylase  50.43 
 
 
236 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1221  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0083  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0506882  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3363  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
236 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586668 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3227  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
236 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1040  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
236 aa  241  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.540297  hitchhiker  0.00000698922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1105  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
236 aa  241  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182057 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1044  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
236 aa  241  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179251 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3224  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
236 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1143  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
236 aa  241  6e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000418679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0663  purine nucleoside phosphorylase  49.15 
 
 
243 aa  240  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002632  purine nucleoside phosphorylase  47.84 
 
 
239 aa  240  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001249  purine nucleoside phosphorylase  49.14 
 
 
236 aa  239  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.328135  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3884  purine nucleoside phosphorylase  49.35 
 
 
236 aa  239  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000380041 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1028  purine nucleoside phosphorylase  50.43 
 
 
236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.263223  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05118  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
236 aa  238  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1926  purine nucleoside phosphorylase  48.28 
 
 
241 aa  238  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0635  purine nucleoside phosphorylase  48.48 
 
 
236 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0114  purine nucleoside phosphorylase  49.79 
 
 
236 aa  237  1e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000527057  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3612  purine nucleoside phosphorylase  48.07 
 
 
236 aa  237  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0457  purine nucleoside phosphorylase  48.92 
 
 
236 aa  236  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1497  purine nucleoside phosphorylase  51.93 
 
 
261 aa  236  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.153254  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0288  purine nucleoside phosphorylase  46.78 
 
 
238 aa  235  4e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.324122  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0828  purine-nucleoside phosphorylase  50.88 
 
 
243 aa  234  8e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2947  purine nucleoside phosphorylase  48.47 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1793  purine nucleoside phosphorylase  50.22 
 
 
232 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000806796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03374  purine nucleoside phosphorylase  47.41 
 
 
269 aa  228  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3381  purine nucleoside phosphorylase  49.14 
 
 
235 aa  227  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336963  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0510  purine nucleoside phosphorylase  45.69 
 
 
236 aa  224  1e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3422  purine nucleoside phosphorylase  48.28 
 
 
234 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2503  purine nucleoside phosphorylase  47.64 
 
 
234 aa  222  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.263795  hitchhiker  0.000530536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3271  purine nucleoside phosphorylase  47.41 
 
 
234 aa  222  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1838  purine nucleoside phosphorylase  47.64 
 
 
234 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.336588  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0752  purine nucleoside phosphorylase  49.35 
 
 
238 aa  221  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2719  purine nucleoside phosphorylase  47.21 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0122  purine nucleoside phosphorylase  50.43 
 
 
235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000853984  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0127  purine nucleoside phosphorylase  50.43 
 
 
235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.391631  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2212  purine nucleoside phosphorylase  47.62 
 
 
236 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2174  purine nucleoside phosphorylase  47.62 
 
 
236 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1657  purine nucleoside phosphorylase  46.78 
 
 
234 aa  219  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0417756  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1003  purine nucleoside phosphorylase  47.21 
 
 
234 aa  218  7e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00510571  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1747  purine nucleoside phosphorylase  46.75 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0295  purine nucleoside phosphorylase  47.62 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3784  purine nucleoside phosphorylase  44.83 
 
 
234 aa  211  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0971  purine nucleoside phosphorylase  44.21 
 
 
239 aa  211  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>