More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0558 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0558  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 231 aa  467  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0933958  normal  0.393198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0622  glycosyl transferase family protein  77.92 
 
 		 231 aa  384  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  57.32 
 
 		 796 aa  265  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  55.56 
 
 		 792 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  55.95 
 
 		 791 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1497  1A family penicillin-binding protein  55.42 
 
 		 846 aa  255  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178558  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2369  1A family penicillin-binding protein  55.42 
 
 		 852 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2411  1A family penicillin-binding protein  55.42 
 
 		 840 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1996  1A family penicillin-binding protein  55.42 
 
 		 840 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704723  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2518  1A family penicillin-binding protein  55.42 
 
 		 840 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.316382  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1268  1A family penicillin-binding protein  55.42 
 
 		 840 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3314  1A family penicillin-binding protein  55.42 
 
 		 840 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.019725  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  54.3 
 
 		 797 aa  254  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  56.22 
 
 		 838 aa  254  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2082  1A family penicillin-binding protein  55.79 
 
 		 840 aa  254  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264276  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  55.37 
 
 		 839 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  55.37 
 
 		 839 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  53.78 
 
 		 797 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  53.78 
 
 		 797 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  56.96 
 
 		 795 aa  252  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  54.22 
 
 		 833 aa  252  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  55.37 
 
 		 837 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  53.78 
 
 		 797 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  53.39 
 
 		 796 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  54.8 
 
 		 799 aa  251  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  56.96 
 
 		 797 aa  251  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  55.79 
 
 		 836 aa  251  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  54.55 
 
 		 839 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  54.55 
 
 		 839 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  54.55 
 
 		 839 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  54.62 
 
 		 786 aa  249  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  54.4 
 
 		 799 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  57.8 
 
 		 777 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  57.34 
 
 		 777 aa  241  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  56.88 
 
 		 801 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  52.02 
 
 		 778 aa  235  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  51.23 
 
 		 778 aa  234  8e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  53.47 
 
 		 771 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  50.4 
 
 		 777 aa  233  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  56.94 
 
 		 679 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3734  1A family penicillin-binding protein  55.73 
 
 		 797 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3763  1A family penicillin-binding protein  55.73 
 
 		 797 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.763292  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3201  1A family penicillin-binding protein  55.73 
 
 		 797 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2752  1A family penicillin-binding protein  55.73 
 
 		 797 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3705  1A family penicillin-binding protein  55.73 
 
 		 797 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2802  1A family penicillin-binding protein  55.73 
 
 		 797 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.437708  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3029  1A family penicillin-binding protein  57.94 
 
 		 797 aa  231  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1752  1A family penicillin-binding protein  57.94 
 
 		 770 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  49.03 
 
 		 804 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  61.88 
 
 		 766 aa  228  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  50.79 
 
 		 824 aa  228  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  64.88 
 
 		 793 aa  226  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  62.22 
 
 		 794 aa  224  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  62.22 
 
 		 779 aa  224  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  53.42 
 
 		 687 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  48.41 
 
 		 805 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  47.58 
 
 		 797 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  62.22 
 
 		 802 aa  218  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  60.56 
 
 		 774 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  60 
 
 		 797 aa  216  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0917  penicillin-binding protein 1A  48.95 
 
 		 752 aa  215  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  49.55 
 
 		 791 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  51.08 
 
 		 778 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0023  1A family penicillin-binding protein  47.79 
 
 		 799 aa  209  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  48.62 
 
 		 793 aa  209  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2152  penicillin-binding protein 1A  51.09 
 
 		 773 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.431826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  56.28 
 
 		 839 aa  205  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  45.16 
 
 		 807 aa  204  7e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4208  1A family penicillin-binding protein  56.28 
 
 		 822 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  56.28 
 
 		 839 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  56.28 
 
 		 839 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  56.28 
 
 		 844 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  56.28 
 
 		 844 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  56.28 
 
 		 844 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  55.74 
 
 		 839 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  55.8 
 
 		 817 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  57.78 
 
 		 830 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0833  penicillin-binding protein, 1A family  54.71 
 
 		 807 aa  195  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1108  penicillin-binding protein 1A  54.44 
 
 		 846 aa  194  8.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  55.74 
 
 		 793 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  44.35 
 
 		 707 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3712  1A family penicillin-binding protein  53.55 
 
 		 839 aa  193  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.637834  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  55.74 
 
 		 793 aa  193  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0395  1A family penicillin-binding protein  53.89 
 
 		 940 aa  192  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000119849 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  59.09 
 
 		 800 aa  192  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0466  penicillin-binding protein  53.89 
 
 		 863 aa  192  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  46.56 
 
 		 790 aa  192  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00516  bifunctional murein transglycosylase/transpeptidase  50.82 
 
 		 887 aa  192  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  53.26 
 
 		 714 aa  191  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3889  peptidoglycan synthetase  57.78 
 
 		 851 aa  191  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  47.62 
 
 		 713 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  47.62 
 
 		 713 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  43.78 
 
 		 794 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  43.78 
 
 		 794 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  47.62 
 
 		 713 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  47.62 
 
 		 713 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  47.62 
 
 		 713 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  53.63 
 
 		 790 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0255  penicillin-binding protein 1A  52.78 
 
 		 865 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  47.62 
 
 		 713 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>