More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6448 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6271  extracellular solute-binding protein family 5  94.65 
 
 
544 aa  1038    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6448  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
545 aa  1108    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00292129  normal  0.318047 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 
531 aa  143  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  29.17 
 
 
530 aa  136  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 
535 aa  133  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1223  4-phytase  29.86 
 
 
589 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  26.83 
 
 
530 aa  129  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  27.06 
 
 
594 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 
533 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 
556 aa  113  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 
544 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  26.45 
 
 
556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  26.43 
 
 
543 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  26.43 
 
 
543 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  26.43 
 
 
543 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  27.23 
 
 
538 aa  110  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  26.43 
 
 
543 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B15  oligopeptide ABC transporter OppAIV  27.08 
 
 
530 aa  109  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.470524  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0334  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
541 aa  108  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.768653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 
541 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
542 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  26.57 
 
 
539 aa  108  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  26.21 
 
 
543 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  28.33 
 
 
544 aa  107  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 
510 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  26.02 
 
 
558 aa  107  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.94 
 
 
543 aa  107  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4866  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 
537 aa  107  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2437  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 
554 aa  106  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5413  4-phytase  26.87 
 
 
537 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0333  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 
528 aa  106  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.31964  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5318  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 
537 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177529  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.27 
 
 
545 aa  106  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5542  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 
537 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390888  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4730  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 
537 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.21 
 
 
558 aa  103  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 
532 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  25.97 
 
 
543 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.99 
 
 
558 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.97 
 
 
543 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 
558 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0115  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  26.26 
 
 
536 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.97 
 
 
543 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.99 
 
 
558 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 
544 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  25.97 
 
 
543 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4505  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 
538 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.347947 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  28.23 
 
 
545 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 
538 aa  101  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  25.74 
 
 
543 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  26.44 
 
 
545 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 
547 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
561 aa  100  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3657  4-phytase  29 
 
 
536 aa  100  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.77 
 
 
543 aa  100  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  24.95 
 
 
554 aa  100  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.21 
 
 
510 aa  99.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  26.16 
 
 
558 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000268358  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 
590 aa  99.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  25.74 
 
 
547 aa  99  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011784  BbuZS7_A28  bacterial extracellular solute-binding protein, family 5  26.17 
 
 
529 aa  98.6  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00880825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.25 
 
 
575 aa  97.8  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 
538 aa  97.1  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3263  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
537 aa  96.7  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35798  normal  0.0152453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 
545 aa  95.9  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2219  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.37 
 
 
550 aa  95.9  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.84 
 
 
504 aa  95.1  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1253  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.95 
 
 
554 aa  94.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.24 
 
 
529 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  25.81 
 
 
575 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  25.81 
 
 
575 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
575 aa  94.4  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 
545 aa  94.4  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4176  4-phytase  25.92 
 
 
534 aa  94.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4438  extracellular solute-binding protein family 5  26.06 
 
 
538 aa  94  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.829261 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0332  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 
523 aa  94.4  6e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0351  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.95 
 
 
554 aa  93.6  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  28.01 
 
 
520 aa  93.6  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1534  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.95 
 
 
554 aa  93.6  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1724  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.95 
 
 
554 aa  93.6  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532344  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3019  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.95 
 
 
554 aa  93.6  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2903  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.95 
 
 
554 aa  93.6  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0385  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.95 
 
 
554 aa  93.6  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.918509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.82 
 
 
536 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.11 
 
 
532 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 
514 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.57 
 
 
520 aa  93.2  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.77 
 
 
545 aa  92.8  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.76 
 
 
536 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0728  extracellular solute-binding protein family 5  26.05 
 
 
535 aa  92  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  25.65 
 
 
525 aa  92.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 
520 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 
533 aa  92.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  26.12 
 
 
535 aa  92.8  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
545 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.22 
 
 
536 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 
511 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  25.59 
 
 
537 aa  91.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
536 aa  91.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  26.69 
 
 
540 aa  92  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>