45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4812 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  100 
 
 		 214 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  67.29 
 
 		 214 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  43.4 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  41.71 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  37.26 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  41.23 
 
 		 211 aa  127  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  41.23 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  38.68 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  36.79 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  37.09 
 
 		 213 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  37.26 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  37.09 
 
 		 213 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  37.26 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  39.43 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  32.55 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  36.41 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  36.32 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  31.6 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  34.13 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  33.49 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  37.74 
 
 		 213 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  40.09 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  32.56 
 
 		 216 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  39.62 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  36.79 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  32.55 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  34.91 
 
 		 236 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  34.91 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  34.1 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  33.96 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  33.96 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  28.64 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  35.92 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  27.83 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  39.15 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  26.51 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  30.91 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  38.14 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  28.96 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  33.18 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  26.94 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  31.93 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  29.91 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0046  hypothetical protein  51.22 
 
 		 81 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1692  hypothetical protein  30.94 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>