43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5017 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  57.28 
 
 		 213 aa  247  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  56.34 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  53.99 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  53.99 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  50.7 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  50.7 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  51.17 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  54.46 
 
 		 213 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  46.01 
 
 		 213 aa  178  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  43.19 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  52.58 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  43.19 
 
 		 213 aa  167  7e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  52.58 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  46.48 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  42.86 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  46.48 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  35.98 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  36.49 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  38.32 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  37.85 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  35.55 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  37.85 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  32.7 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  36.79 
 
 		 214 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  41.31 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  33.01 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  33.64 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  37.38 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  29.95 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  34.91 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  35.59 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  34.72 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  34.5 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  34.1 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  30.63 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  37.8 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  32.87 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  33.33 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  32.39 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  26.4 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  40.98 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  31.34 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>