42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3063 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  71.36 
 
 		 213 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  70.42 
 
 		 213 aa  257  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  78.87 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  61.5 
 
 		 213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  52.11 
 
 		 213 aa  211  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  52.58 
 
 		 213 aa  204  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  52.11 
 
 		 213 aa  191  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  55.4 
 
 		 213 aa  177  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  50.47 
 
 		 213 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  50.47 
 
 		 213 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  44.39 
 
 		 213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  42.25 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  46.48 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  43.9 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  41.78 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  41.78 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  37.09 
 
 		 213 aa  121  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  39.44 
 
 		 212 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  46.01 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  40.38 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  37.8 
 
 		 208 aa  111  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  35.19 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  38.97 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  39.15 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  37.74 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  38.32 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  37.85 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  37.85 
 
 		 211 aa  95.1  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  36.62 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  38.43 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  44.26 
 
 		 128 aa  85.1  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  37.38 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  36.62 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  35.81 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  31.51 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  30.7 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  33.33 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  33.8 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  31.94 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  38.81 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>