43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2035 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  407  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  39.76 
 
 
226 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  34.74 
 
 
213 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  36.44 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  36.07 
 
 
211 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  37.5 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  33.49 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  36 
 
 
211 aa  95.9  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  35.24 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  36.07 
 
 
212 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  36.11 
 
 
216 aa  89  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  34.56 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  37.56 
 
 
214 aa  88.2  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  36.36 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  38.15 
 
 
213 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  33.73 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  34.25 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  39.29 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  32.6 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  33.8 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  36.15 
 
 
213 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  31.79 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  33.53 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  35.94 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  31.79 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  36.62 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  36.2 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  34.8 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  34.8 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  35.75 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  33.73 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  32.57 
 
 
213 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  31.95 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  31.38 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  34.74 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1692  hypothetical protein  32.58 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  38.71 
 
 
214 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  33.48 
 
 
213 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  32.93 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  36.84 
 
 
213 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  32.34 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  28.31 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.76812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>