36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3134 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  407  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  47.64 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  41.51 
 
 		 212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  43.87 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  42.45 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  42.92 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  44.34 
 
 		 214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  39.72 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  40.19 
 
 		 212 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  39.36 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  32.39 
 
 		 213 aa  94.7  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  35.05 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  32.88 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  34.86 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  36.2 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  46.15 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  36.82 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  34.7 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  29.91 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  34.7 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  31.8 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  30.88 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  30.86 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  33.19 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  33.13 
 
 		 226 aa  62  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  35.05 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  28.31 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  30.91 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  33.8 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  32.35 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  33.94 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  33.64 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  32.56 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  31.78 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  29.91 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  27.85 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>