42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0995 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  95.77 
 
 		 213 aa  354  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  70.42 
 
 		 213 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  57.94 
 
 		 213 aa  234  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  72.77 
 
 		 213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  50.7 
 
 		 213 aa  207  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  51.17 
 
 		 213 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  46.48 
 
 		 213 aa  188  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  51.64 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  56.81 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  47.89 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  48.83 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  48.83 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  45.37 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  40.38 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  40.85 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  40.85 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  35.21 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  47.89 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  38.71 
 
 		 226 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  34.27 
 
 		 212 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  35.21 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  37.26 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  35.1 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  33.8 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  34.74 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  36.15 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  36.45 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  36.32 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  35.98 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  37.04 
 
 		 216 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  32.7 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  43.44 
 
 		 128 aa  87.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  36.41 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  35.81 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  30.88 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  32.26 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  32.86 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  33.18 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  31.31 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  29.15 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>