41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2176 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  99.06 
 
 		 213 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  61.97 
 
 		 213 aa  250  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  47.89 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  46.48 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  41.31 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  43.19 
 
 		 213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  43.19 
 
 		 213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  43.19 
 
 		 213 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  39.91 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  41.78 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  40.38 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  36.62 
 
 		 213 aa  124  9e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  43.66 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  40.85 
 
 		 213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  39.04 
 
 		 205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  43.19 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  41.76 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  31.46 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  31.73 
 
 		 208 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  32.56 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  42.72 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  32.24 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  33.49 
 
 		 210 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  32.24 
 
 		 212 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  30.41 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  34.91 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  34.27 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  34.55 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  32.57 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  28.64 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  33.8 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  36.92 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  31.64 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  32.82 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  33.13 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  32.19 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  31.34 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  28.84 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  32.16 
 
 		 210 aa  42  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>