33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0818 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  247  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  46.72 
 
 		 213 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  40.16 
 
 		 213 aa  94.4  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  43.44 
 
 		 205 aa  90.9  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  42.37 
 
 		 213 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  41.53 
 
 		 213 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  45.3 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  42.24 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  42.59 
 
 		 213 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  45.37 
 
 		 213 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  38.46 
 
 		 213 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  37.8 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  36.29 
 
 		 213 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  37.07 
 
 		 213 aa  70.5  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  35.54 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  35.54 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  36.36 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  36.36 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  36.75 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  30.83 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  29.1 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  30.83 
 
 		 216 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  40.52 
 
 		 213 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  34.86 
 
 		 214 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  31.75 
 
 		 213 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  36.46 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  25.98 
 
 		 212 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  35.78 
 
 		 211 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  35.78 
 
 		 211 aa  47  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  30.48 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  33.94 
 
 		 211 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  37.62 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  29.52 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>