43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2181 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  56.34 
 
 		 213 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  56.34 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  57.94 
 
 		 213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  57.94 
 
 		 213 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  61.5 
 
 		 213 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  55.4 
 
 		 213 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  55.4 
 
 		 213 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  59.62 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  58.41 
 
 		 213 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  52.58 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  43.66 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  46.01 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  42.25 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  47.89 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  47.42 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  42.93 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  47.42 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  38.03 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  38.97 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  40.28 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  38.68 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  35.75 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  39.15 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  37.85 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  39.53 
 
 		 210 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  34.6 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  38.32 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  34.12 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  32.86 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  34.26 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  45.3 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  36.57 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  35.71 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  29.77 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  36.15 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  32.57 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  30.56 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  31.65 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  27.04 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  27.1 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  35.92 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0046  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>