20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0046 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0046  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  83.33 
 
 		 212 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  83.33 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  83.33 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  76.19 
 
 		 213 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  71.43 
 
 		 216 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  71.43 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  71.43 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  54.76 
 
 		 226 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  63.16 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  53.85 
 
 		 214 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  52.38 
 
 		 213 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  50 
 
 		 213 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  51.28 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  52.63 
 
 		 213 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1554  hypothetical protein  41.03 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  48.78 
 
 		 213 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  47.62 
 
 		 214 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  53.85 
 
 		 210 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  42.86 
 
 		 213 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>