46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0063 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  401  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  57.42 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  58.17 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  58.65 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  55 
 
 		 216 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  57.69 
 
 		 210 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  65.87 
 
 		 216 aa  201  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  35.58 
 
 		 213 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  35.1 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  35.75 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  35.38 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  33.01 
 
 		 213 aa  97.8  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  35.58 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  36.06 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  37.8 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  35.1 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  30.29 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  39.36 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  26.96 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  35.58 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  31.95 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  34.13 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  34.91 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  31.73 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  31.73 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  35.24 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  36.27 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  38.98 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  35.79 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0046  hypothetical protein  83.33 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0047  hypothetical protein  52.56 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  42.96 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  30.99 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  29.86 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  30.32 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  32.71 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  29.61 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  32.24 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  42.39 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  36.96 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  33.49 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  33.49 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  29.1 
 
 		 128 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  32.56 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1554  hypothetical protein  43.86 
 
 		 85 aa  46.2  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  31.98 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>