43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3008 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  66.51 
 
 		 212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  66.51 
 
 		 212 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  65.09 
 
 		 212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  61.79 
 
 		 214 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  47.64 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  42.45 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  33.64 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  33.33 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  33.33 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  31.98 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  35.09 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  35.43 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  33.49 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  29.25 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  35.29 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  30.32 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  32.24 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  33.94 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  31.05 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  37.96 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  32.86 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  32.67 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  31.51 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  28.31 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  42.11 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  34.12 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  30.62 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  32.26 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  32.13 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  30.41 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  28.57 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  31.13 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  31.34 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  29.31 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  29.31 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  36.87 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  30.88 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  28.15 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  29.22 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  30.37 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  45.4  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>