42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2589 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  64.88 
 
 		 205 aa  269  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  45.54 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  46.01 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  42.25 
 
 		 213 aa  168  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  46.01 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  46.95 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  47.89 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  48.83 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  46.48 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  37.09 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  45.12 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  42.25 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  42.25 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  39.91 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  39.91 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  35.38 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  47.42 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  40.85 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  40.85 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  43.19 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  46.34 
 
 		 128 aa  99.8  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  35.35 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  36.45 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  32.41 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  34.74 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  34.74 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  30.29 
 
 		 208 aa  91.7  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  37.09 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  31.02 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  34.27 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  37.85 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  28.04 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  30.84 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  34.82 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  33.8 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  31.31 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  32.24 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  32.56 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  29.56 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  33.64 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  29.91 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>