42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1521 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  403  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  64.88 
 
 
213 aa  260  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  44.39 
 
 
213 aa  168  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  42.93 
 
 
213 aa  148  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  42.86 
 
 
213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  38.05 
 
 
213 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  45.37 
 
 
213 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  43.9 
 
 
213 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  42.77 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  42.77 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  43.41 
 
 
213 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  43.9 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  38.1 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  43.11 
 
 
213 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  44.91 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  35.29 
 
 
211 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  42.08 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  42.08 
 
 
211 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  44.88 
 
 
213 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  39.52 
 
 
226 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  39.04 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  37.25 
 
 
213 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  43.44 
 
 
128 aa  90.9  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  39.76 
 
 
214 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  29.74 
 
 
213 aa  84.7  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  31.95 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  39.16 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  38.73 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  28.29 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  32.04 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  35.43 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  28.88 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  31.43 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  31.07 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  32.89 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  31.74 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  28.78 
 
 
210 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  29.76 
 
 
216 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  30.88 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  28.03 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  32.53 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  38.46 
 
 
214 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0488886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>