41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2033 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  100 
 
 		 213 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  99.06 
 
 		 236 aa  403  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  61.97 
 
 		 213 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  47.42 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  46.48 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  41.31 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  43.66 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  43.66 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  42.72 
 
 		 213 aa  131  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  39.91 
 
 		 213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  36.62 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  40.38 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  41.78 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  40.85 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  43.19 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  42.72 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  31.92 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  39.66 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  41.76 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  31.73 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  32.56 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  42.25 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  32.71 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  32.24 
 
 		 212 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  33.49 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  29.95 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  34.91 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  32.57 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  32.11 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  34.27 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  28.64 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  33.64 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  33.8 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  36.92 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  31.46 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  32.82 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  35.21 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  31.51 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  30.88 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  28.84 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  32.16 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>