43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3554 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  87.26 
 
 		 212 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  78.3 
 
 		 212 aa  260  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  65.09 
 
 		 212 aa  249  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  61.79 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  43.4 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  41.12 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  34.27 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  32.26 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  33.64 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  32.41 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  33.18 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  32.86 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  33.8 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  32.39 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  33.91 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  31.22 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  26.29 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  30.94 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  31.92 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  30.91 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  29.11 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  33.02 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  29.71 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  38.95 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  31.25 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  33.63 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  32.27 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  29.11 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  32.39 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  32.39 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  30.41 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  30.41 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  27.83 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  30.84 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  34.27 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  28.83 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1692  hypothetical protein  32.18 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  28.57 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  34.78 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  28.38 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1434  hypothetical protein  28.5 
 
 		 218 aa  42  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>