43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1215 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  100 
 
 		 213 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  41.78 
 
 		 213 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  46.48 
 
 		 213 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  44.39 
 
 		 205 aa  168  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  45.54 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  43.66 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  46.48 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  43.19 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  45.54 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  40.65 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  41.78 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  41.78 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  43.19 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  35.21 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  45.79 
 
 		 213 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  40.38 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  37.09 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  40.09 
 
 		 214 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  37.38 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  35.1 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  42.72 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  36.15 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  35.65 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  37.26 
 
 		 214 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  36.62 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  40.64 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  35.21 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  36.62 
 
 		 236 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  40.64 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  32.39 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  35.07 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  39.35 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  40.16 
 
 		 128 aa  94.4  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  34.74 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  33.8 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  37.09 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  35.02 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  31.98 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  31.16 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  31.8 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  32.71 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  31.05 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  26.06 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>